191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4810 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  780    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  44.62 
 
 
409 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  44.27 
 
 
436 aa  279  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 
411 aa  266  5e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  43.35 
 
 
404 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 
397 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  42.93 
 
 
406 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  44.81 
 
 
466 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  45.59 
 
 
414 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  39.84 
 
 
403 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  39.84 
 
 
403 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  39.32 
 
 
403 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  43.01 
 
 
406 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  39.07 
 
 
419 aa  208  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 
496 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  37.1 
 
 
434 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 
403 aa  187  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
426 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  38.87 
 
 
387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  39.12 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
404 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  38.06 
 
 
404 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  36.44 
 
 
414 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 
445 aa  180  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  36.42 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  36.13 
 
 
426 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  35.67 
 
 
409 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  37.47 
 
 
426 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 
401 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  36.31 
 
 
426 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  41.83 
 
 
459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  36.34 
 
 
426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  37.5 
 
 
405 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  40.68 
 
 
404 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  37.5 
 
 
403 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 
430 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 
430 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
424 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  34.6 
 
 
421 aa  162  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 
413 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  38.58 
 
 
451 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  36.32 
 
 
407 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  35.88 
 
 
426 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  38.35 
 
 
403 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14270  cyanate permease  33.59 
 
 
423 aa  158  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000572632  normal  0.0539655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
439 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  40.56 
 
 
404 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 
437 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  35.36 
 
 
432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  34.54 
 
 
405 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  35.31 
 
 
424 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  36.07 
 
 
406 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  35.89 
 
 
361 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
397 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  36.46 
 
 
444 aa  151  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  33.17 
 
 
402 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  28.57 
 
 
396 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  34.95 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  32.82 
 
 
391 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  31.27 
 
 
403 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  38.57 
 
 
405 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  37.75 
 
 
401 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  32.86 
 
 
394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  36.25 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  37.2 
 
 
366 aa  140  6e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  32.81 
 
 
382 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  27.73 
 
 
394 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 
415 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3103  major facilitator transporter  33.24 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  32.96 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  30.39 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  29.37 
 
 
411 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  36.54 
 
 
404 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  29.1 
 
 
404 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  34.48 
 
 
393 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  30.63 
 
 
416 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  33.5 
 
 
395 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  34.22 
 
 
393 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  34.22 
 
 
393 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  34.22 
 
 
393 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  34.22 
 
 
393 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  34.22 
 
 
393 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  34.22 
 
 
393 aa  123  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  33.72 
 
 
409 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  34.01 
 
 
409 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  33.33 
 
 
409 aa  122  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  34.22 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  33.62 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
389 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  31.35 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  32.88 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  30.52 
 
 
401 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  26.39 
 
 
368 aa  121  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  34.13 
 
 
393 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>