176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3103 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3103  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  771    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2804  major facilitator superfamily MFS_1  75.88 
 
 
408 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0284849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  34.5 
 
 
403 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  34.5 
 
 
403 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  34.6 
 
 
403 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  34.67 
 
 
406 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  34.64 
 
 
409 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  37.01 
 
 
466 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
496 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
411 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
445 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
397 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 
428 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  36.2 
 
 
414 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  34.25 
 
 
406 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  33.42 
 
 
388 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  29.92 
 
 
421 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  34.04 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  32.16 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  32.32 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
401 aa  147  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  32.34 
 
 
419 aa  145  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
404 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
413 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
404 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  31.23 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  32.85 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  32.63 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  33.16 
 
 
404 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  35.42 
 
 
404 aa  133  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
397 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  31.19 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  29.81 
 
 
416 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  34.03 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  32.14 
 
 
459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
424 aa  129  6e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  30.46 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  29.82 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  29.82 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  29.82 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  29.82 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  29.55 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  32.97 
 
 
426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  23.65 
 
 
396 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
423 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  32.45 
 
 
404 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
415 aa  126  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
439 aa  126  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  31.16 
 
 
426 aa  125  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  29.04 
 
 
414 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
398 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
396 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  24.64 
 
 
394 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  29.73 
 
 
402 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  29.79 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  28.17 
 
 
436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  30 
 
 
434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  28.34 
 
 
393 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  28.34 
 
 
393 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  28.34 
 
 
393 aa  121  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  28.34 
 
 
393 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
435 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  28.34 
 
 
393 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  28.31 
 
 
393 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  28.34 
 
 
393 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  28.34 
 
 
393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  32.6 
 
 
398 aa  119  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  27.85 
 
 
395 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  27.75 
 
 
398 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  30.79 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  30.64 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  29.01 
 
 
424 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  25.46 
 
 
368 aa  117  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  33.69 
 
 
451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  30.42 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  24.8 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  30.55 
 
 
434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  26.77 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  31.51 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  28.53 
 
 
434 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  30.35 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
399 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  32.03 
 
 
366 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
437 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0581  major facilitator transporter  28.5 
 
 
397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
426 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  30.08 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  28.07 
 
 
439 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  23.86 
 
 
390 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
396 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0155  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
421 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.75264  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0049  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
410 aa  102  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  28.89 
 
 
405 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0819  cyanate permease  24.78 
 
 
395 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>