181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14270 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14270  cyanate permease  100 
 
 
423 aa  785    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000572632  normal  0.0539655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03160  cyanate permease  55.31 
 
 
405 aa  358  9e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  50.25 
 
 
419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  34.96 
 
 
409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 
401 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
413 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  34.99 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 
417 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  31.89 
 
 
404 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  33.66 
 
 
426 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
413 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  36.18 
 
 
387 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
411 aa  139  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  35 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  35 
 
 
403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
397 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  35 
 
 
403 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 
445 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  35.11 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
428 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  33.68 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  35.9 
 
 
406 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3455  major facilitator transporter  32.85 
 
 
369 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  33.33 
 
 
426 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 
496 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  32.98 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  33.33 
 
 
426 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  31.98 
 
 
421 aa  130  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  32.98 
 
 
426 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  32.2 
 
 
403 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  36.24 
 
 
459 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 
430 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  31.25 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  27.92 
 
 
402 aa  122  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
424 aa  122  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  28.46 
 
 
416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
397 aa  121  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  35.33 
 
 
407 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  31.59 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
435 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  33.97 
 
 
401 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  32.25 
 
 
403 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  29.2 
 
 
411 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  30.99 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  30.88 
 
 
426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  31.69 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  30.87 
 
 
434 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4107  major facilitator transporter  31.65 
 
 
466 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.24633  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  32.19 
 
 
432 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  27.43 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 
410 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  26.73 
 
 
398 aa  111  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  26.15 
 
 
398 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  29.65 
 
 
391 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  25.2 
 
 
439 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  31.66 
 
 
406 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2195  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
415 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
401 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  31.61 
 
 
414 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  30.23 
 
 
451 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  29.26 
 
 
394 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  30.42 
 
 
424 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  25.43 
 
 
401 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  29.93 
 
 
426 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  25.43 
 
 
401 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  25.18 
 
 
401 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  34.88 
 
 
405 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  31.37 
 
 
404 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0090  major facilitator transporter  27.2 
 
 
429 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  31.37 
 
 
405 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  25.6 
 
 
436 aa  100  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  29.68 
 
 
444 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  29.1 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  24.68 
 
 
401 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  29.4 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  31.32 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  28.81 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  29.5 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  30.31 
 
 
424 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  28.53 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  28.53 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  28.53 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  28.53 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  31.11 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  28.53 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  28.53 
 
 
393 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
423 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  28.25 
 
 
398 aa  91.7  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  30.34 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  30.34 
 
 
394 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  30.34 
 
 
394 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>