192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2202 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  797    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  56.66 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  49.02 
 
 		 409 aa  328  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  55.88 
 
 		 420 aa  290  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 409 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  43.83 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  39.66 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  40.87 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  40.25 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  40.25 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  40 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  40.25 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  40.25 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  40.25 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  40 
 
 		 384 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  40 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 398 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  38.6 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 401 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 392 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 427 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  38.52 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 396 aa  169  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  28.69 
 
 		 394 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  39.27 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  35.36 
 
 		 384 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  40.34 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  40.34 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 426 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  40.06 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  40.06 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  34.7 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  32.32 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  33.52 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  29.94 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  30.79 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  30.23 
 
 		 409 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  29.34 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  28.57 
 
 		 426 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  32.31 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  28.69 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  29.14 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 		 400 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00339  MFS transporter  29.68 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0321452  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  31.15 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 410 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  31.05 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  32 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  30.42 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  30.53 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  30.42 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  30.42 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  30.68 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  30.65 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  30.16 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.298139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>