184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2258 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  32.62 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 408 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 401 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  31.33 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  31.33 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  32.38 
 
 		 384 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  32.12 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  33.43 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  31.87 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  31.87 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  31.61 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  32.38 
 
 		 384 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  33.76 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  32.98 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 411 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  26.44 
 
 		 403 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  31.89 
 
 		 409 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 404 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  29.3 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 426 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  33.43 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  30.81 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2715  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000964396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  32.32 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1245  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.356347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  30.99 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  28.09 
 
 		 414 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  28.17 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 424 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  28.37 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2217  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  26.4 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  27.61 
 
 		 426 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  26.13 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1764  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  26.13 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  26.13 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  26.13 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  26.13 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  26.13 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  26.13 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  27.39 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  26.57 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  28.61 
 
 		 426 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  27.04 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 439 aa  106  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  23.78 
 
 		 436 aa  106  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  28.1 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  28.1 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>