More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_30600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_30600  putative permease  100 
 
 		 404 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  60.62 
 
 		 427 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  28.02 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 449 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  30 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2882  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2885  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7416  Permeases of the major facilitator superfamily  26.29 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0651373  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1941  putative permease  23.98 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.249654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0509  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0837789 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  26.57 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3959  hypothetical protein  28.17 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  27.18 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11680  sugar phosphate permease  26.7 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.47668  normal  0.233511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5313  MFS permease  25.54 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  25.63 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 441 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  29.13 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  29.71 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2113  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473002  normal  0.06428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2729  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3307  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0308  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.88 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4678  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  24.51 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2213  major facilitator superfamily transporter  35.56 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0023669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  21.57 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.66 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  30.33 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>