More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1702 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 473 aa  877    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.39 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3481  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.27 
 
 		 485 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0762295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.17 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0874  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.92 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0132531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8102  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.11 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 558 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.89 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4154  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 483 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 491 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 		 510 aa  146  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1713  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.59 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0126419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2718  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.41 
 
 		 467 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2059  major facilitator superfamily drug efflux transporter  32.32 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0947  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.15 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.635286 
 
 
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NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.98 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.35 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 500 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.66 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 		 534 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3300  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.71 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2825  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.09 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.448147  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1686  major facilitator superfamily permease  28.32 
 
 		 455 aa  130  5.0000000000000004e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.15 
 
 		 509 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
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NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 646 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.36 
 
 		 646 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
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NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.6 
 
 		 646 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.54 
 
 		 534 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.76 
 
 		 511 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
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NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.8 
 
 		 531 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 		 530 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 514 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.7 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 520 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
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NC_009565  TBFG_10798  multi-drug resistance integral membrane efflux protein emrB  32.08 
 
 		 540 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.52 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.591256  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  25.91 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.53 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.74 
 
 		 529 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 514 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0097  major facilitator superfamily permease  26.56 
 
 		 493 aa  119  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000342925  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.58 
 
 		 558 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1271  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.95 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00841234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00107879  normal  0.0501756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0963  major facilitator superfamily permease  32.36 
 
 		 449 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337437  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  26.54 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.57 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.17 
 
 		 514 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.17 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 515 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 480 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 480 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1393  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 508 aa  116  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.230951  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  25.68 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28 
 
 		 524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.68 
 
 		 480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1760  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.57 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5732  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3795  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.6 
 
 		 475 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1423  major facilitator superfamily permease  25.66 
 
 		 464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.904673  hitchhiker  0.0000661431 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.4 
 
 		 537 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27 
 
 		 513 aa  114  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_1318  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.05 
 
 		 480 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  27.3 
 
 		 561 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.3 
 
 		 511 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 545 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.85 
 
 		 627 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.09 
 
 		 474 aa  113  9e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.98 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0760  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.88 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  31.34 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  33.96 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.82 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 510 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.89 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.78 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.090141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.9 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.34 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
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NC_007958  RPD_2260  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.3 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_0114  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.512098  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.25 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2493  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 475 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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