93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30340 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_33613  Monocarboxylate transporter  85.9 
 
 
453 aa  791    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30340  monocarboxylate permease homolog  100 
 
 
454 aa  912    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.22847  normal  0.486952 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30034  monocarboxylate permease homolog  46.09 
 
 
471 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_36120  monocarboxylate permease homologue  36.85 
 
 
439 aa  293  5e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.590226  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37914  monocarboxylate permease  38.24 
 
 
421 aa  273  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  33.76 
 
 
510 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02358  conserved hypothetical protein  31.47 
 
 
448 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04098  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12790)  32.26 
 
 
432 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.180766  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02840  Monocarboxylate transporter-like protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874I2]  29.44 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00450414 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  31.8 
 
 
482 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08413  Exporter (Eurofung)  31.85 
 
 
487 aa  182  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02430  transporter, putative  31.02 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09333  Monocarboxylate transporter (Eurofung)  25.95 
 
 
1072 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143082  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06429  conserved hypothetical protein  30.64 
 
 
450 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000314614  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02746  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05170)  28.16 
 
 
436 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10624  normal  0.606528 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08366  conserved hypothetical protein  28.97 
 
 
443 aa  158  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00528  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 
428 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07898  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 
444 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189229 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  28.85 
 
 
437 aa  147  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11092  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00780)  27.81 
 
 
429 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08507  conserved hypothetical protein  29.17 
 
 
442 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000272571  normal  0.0467557 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08934  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 
432 aa  127  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279116  normal  0.171423 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08995  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.343646  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  23.94 
 
 
539 aa  113  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10410  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05660)  25.14 
 
 
463 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
430 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  26.19 
 
 
506 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04780  transporter, putative  20.77 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60420  Monocarboxylate transporter  24.1 
 
 
606 aa  81.3  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.94 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  26.92 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  25.82 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66842  Monocarboxylate transporter  25.81 
 
 
523 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.756809  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00382  conserved hypothetical protein  24.38 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.483228  normal  0.39904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.21 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.124672 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  21.05 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04810  transporter, putative  23.54 
 
 
448 aa  68.2  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  26.36 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4224  major facilitator transporter  22.88 
 
 
411 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25 
 
 
439 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04790  transporter, putative  22.22 
 
 
449 aa  61.2  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  23.38 
 
 
413 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1829  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 
414 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_4422  Monocarboxylate transporter  22.6 
 
 
410 aa  57  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25.09 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3905  major facilitator transporter  20.71 
 
 
416 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.187616  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2073  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.621  normal  0.521626 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6367  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 
409 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
417 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  23.99 
 
 
402 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04800  monocarboxylic acid transporter, putative  21.69 
 
 
447 aa  53.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5858  major facilitator transporter  23.48 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1067  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
417 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  23.94 
 
 
426 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32560  Monocarboxylate transporter  23.56 
 
 
512 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3665  major facilitator transporter  20.57 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  22.68 
 
 
413 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.26 
 
 
412 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5540  major facilitator transporter  30.3 
 
 
410 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.477353 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07021  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
291 aa  50.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.64 
 
 
430 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0943  major facilitator transporter  23.46 
 
 
407 aa  50.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.95 
 
 
398 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7884  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
411 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  24.5 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00830  monocarboxylic acid transporter, putative  21.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02591  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14260)  21.65 
 
 
483 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0146551  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  21.34 
 
 
434 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6050  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
419 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  22.22 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.13 
 
 
410 aa  47.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.84 
 
 
407 aa  47  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  23.93 
 
 
427 aa  46.6  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26060  sugar phosphate permease  26.44 
 
 
445 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  22.47 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  22.47 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  22.47 
 
 
398 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  20.9 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0333  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
437 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4068  major facilitator transporter  27.93 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  23.16 
 
 
528 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  21.64 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  21.65 
 
 
411 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
421 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  21.73 
 
 
412 aa  43.9  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  22.65 
 
 
400 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>