More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2627 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  80.28 
 
 		 452 aa  724    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  81.29 
 
 		 433 aa  717    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  76.21 
 
 		 435 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  77.73 
 
 		 435 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  83.6 
 
 		 432 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  76.21 
 
 		 435 aa  680    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  80.28 
 
 		 452 aa  724    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  76.21 
 
 		 435 aa  680    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  96.79 
 
 		 436 aa  860    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  879    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  85.85 
 
 		 433 aa  768    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  46.7 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  44.72 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  44.55 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  44.72 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  44.55 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  44.55 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  44.55 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  44.55 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  44.72 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  43.61 
 
 		 435 aa  359  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  44.23 
 
 		 432 aa  359  6e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  44.47 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  44.47 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  44.47 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  44.47 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  44.47 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  43.83 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  43.1 
 
 		 433 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  44.04 
 
 		 474 aa  350  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  43.06 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  43.06 
 
 		 425 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  42.11 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  42.11 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  42.11 
 
 		 434 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  42.14 
 
 		 432 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  42.76 
 
 		 434 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  43.28 
 
 		 430 aa  345  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  43.14 
 
 		 433 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  42.57 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  42.57 
 
 		 436 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  39.57 
 
 		 433 aa  306  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  39.67 
 
 		 430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  32.68 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  30.08 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  32.95 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  31.42 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 480 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  31.67 
 
 		 442 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 441 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 436 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  30.88 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 430 aa  190  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  31.1 
 
 		 439 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 427 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 445 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 432 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  27.79 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 430 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 		 453 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 454 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>