More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13092 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  622  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  83.87 
 
 
310 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  83.87 
 
 
310 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  83.87 
 
 
310 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  82.35 
 
 
306 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  81.76 
 
 
307 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  81.05 
 
 
306 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  76.33 
 
 
281 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  64.71 
 
 
321 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  49.82 
 
 
287 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  50.18 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  50.19 
 
 
289 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  52.03 
 
 
277 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  49.25 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0204  HpcH/HpaI aldolase  46.47 
 
 
311 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.446132  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  49.06 
 
 
281 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2654  HpcH/HpaI aldolase  45.08 
 
 
267 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  41.95 
 
 
270 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  41.67 
 
 
270 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.22 
 
 
269 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  42.54 
 
 
274 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  42.54 
 
 
274 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  35.32 
 
 
291 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  34.96 
 
 
294 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  37.34 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  34.96 
 
 
294 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  38.58 
 
 
276 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.21 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.16 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  36.63 
 
 
282 aa  129  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  36.6 
 
 
271 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
279 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  36.12 
 
 
268 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
274 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  34.6 
 
 
270 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  30.77 
 
 
293 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  36.95 
 
 
290 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  36.26 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  36.26 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.87 
 
 
286 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 
295 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  35.08 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  38.82 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  32.96 
 
 
278 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  32.85 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  32.85 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  32.57 
 
 
292 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  32.85 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  32.85 
 
 
293 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  35.56 
 
 
289 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  32.46 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  28.41 
 
 
276 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  34.18 
 
 
278 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  33.96 
 
 
273 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  33.19 
 
 
275 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  32.94 
 
 
274 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  32.93 
 
 
292 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  29.01 
 
 
293 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  35.51 
 
 
297 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  32.49 
 
 
293 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.49 
 
 
293 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  31.34 
 
 
274 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  36.96 
 
 
281 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 
281 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  32.02 
 
 
292 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  31.85 
 
 
272 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  32.13 
 
 
293 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  30.38 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.38 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  34.43 
 
 
292 aa  99  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  30.38 
 
 
280 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  37.19 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  35.6 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  31.52 
 
 
274 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  32.94 
 
 
289 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  32.61 
 
 
289 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  31.29 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  33.73 
 
 
280 aa  94  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
290 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  34.94 
 
 
275 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  31.73 
 
 
289 aa  92.8  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  29.81 
 
 
267 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1361  HpcH/HpaI aldolase  33.19 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0742022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  32.68 
 
 
291 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  32.78 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  33.82 
 
 
276 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  34.94 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  35.78 
 
 
276 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.48 
 
 
280 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.34 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.48 
 
 
280 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.48 
 
 
280 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  31.48 
 
 
280 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  28.99 
 
 
324 aa  89  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  28.99 
 
 
324 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  31.05 
 
 
325 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  29.6 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>