More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3539 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
279 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  43.06 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  46.64 
 
 
269 aa  219  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2417  HpcH/HpaI aldolase  51.48 
 
 
271 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.21523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3810  HpcH/HpaI aldolase  51.34 
 
 
279 aa  209  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  48.52 
 
 
275 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  46.13 
 
 
274 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  46.13 
 
 
274 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6108  HpcH/HpaI aldolase  44.49 
 
 
268 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000904095  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  46.67 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  41.58 
 
 
282 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4556  HpcH/HpaI aldolase  47.06 
 
 
274 aa  194  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5807  citrate lyase  47.41 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6171  citrate (pro-3S)-lyase  47.41 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  46.18 
 
 
270 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  44.16 
 
 
274 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  43.82 
 
 
270 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  44.57 
 
 
291 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6127  HpcH/HpaI aldolase  38.99 
 
 
294 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.986067 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  43.12 
 
 
274 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  41.91 
 
 
277 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  43.45 
 
 
291 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  44.57 
 
 
270 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6415  HpcH/HpaI aldolase  38.63 
 
 
294 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4110  HpcH/HpaI aldolase  47.78 
 
 
266 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3486  HpcH/HpaI aldolase  45.82 
 
 
279 aa  185  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6894  Citryl-CoA lyase  46.69 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  39.63 
 
 
271 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  43.62 
 
 
278 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3049  HpcH/HpaI aldolase  44.09 
 
 
272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.100849  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4801  HpcH/HpaI aldolase  43.84 
 
 
289 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1689  HpcH/HpaI aldolase  49.22 
 
 
268 aa  169  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.69146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  46.52 
 
 
297 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  43.48 
 
 
295 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0114  HpcH/HpaI aldolase  44.57 
 
 
289 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0131  HpcH/HpaI aldolase  44.69 
 
 
289 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  45.52 
 
 
290 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  41.57 
 
 
275 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4631  acyl-CoA lyase beta chain  41.2 
 
 
275 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  43.38 
 
 
289 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7302  HpcH/HpaI aldolase  43.68 
 
 
283 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.488108  normal  0.498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.36 
 
 
286 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  39.85 
 
 
278 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  40.07 
 
 
275 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4340  HpcH/HpaI aldolase  37.64 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0552046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  38.04 
 
 
276 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3032  HpcH/HpaI aldolase  35.42 
 
 
289 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.752925  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0865  HpcH/HpaI aldolase  35.38 
 
 
276 aa  150  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.903723  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  32.36 
 
 
293 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1107  HpcH/HpaI aldolase  50.31 
 
 
189 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0202  HpcH/HpaI aldolase  42.7 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2742  HpcH/HpaI aldolase  34.32 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00490393 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3835  putative aldolase/citrate lyase  45.42 
 
 
276 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  37.77 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0181  HpcH/HpaI aldolase  34.85 
 
 
281 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  36.99 
 
 
310 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4282  HpcH/HpaI aldolase  38.15 
 
 
280 aa  139  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.41121  normal  0.174407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.16 
 
 
275 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.4 
 
 
280 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.4 
 
 
280 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.4 
 
 
280 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  30.99 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.04 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.14 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2378  HpcH/HpaI aldolase  33.81 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.0302108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3200  HpcH/HpaI aldolase  38.89 
 
 
274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.19 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4009  HpcH/HpaI aldolase  34.53 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.783796  decreased coverage  0.00557053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13092  hypothetical protein  34.55 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00883789  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2688  HpcH/HpaI aldolase  33.21 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  34.64 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  36.92 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  34.29 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36 
 
 
280 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36 
 
 
280 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  34.29 
 
 
305 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  36 
 
 
280 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4467  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 
307 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.99201  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  35.15 
 
 
293 aa  128  8.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  33.58 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  37.99 
 
 
285 aa  126  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12520  citrate lyase beta subunit citE  38.01 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5584  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.331432  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5204  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5292  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
310 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00870  citrate lyase beta subunit  33.33 
 
 
321 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0531316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  35.23 
 
 
281 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1039  HpcH/HpaI aldolase  40 
 
 
271 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19950  citrate lyase beta subunit  35.39 
 
 
281 aa  123  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.251575  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  36.33 
 
 
281 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  37.09 
 
 
272 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  37.09 
 
 
272 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  37.09 
 
 
272 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 
282 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  34.18 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>