More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2156 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
280 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  100 
 
 
280 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  99.64 
 
 
280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  72.3 
 
 
280 aa  410  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  71.94 
 
 
280 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  71.94 
 
 
280 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  71.94 
 
 
280 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  59.11 
 
 
274 aa  320  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  45.93 
 
 
293 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  45.93 
 
 
293 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  45.93 
 
 
293 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  45.93 
 
 
293 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  45.93 
 
 
293 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  45.93 
 
 
293 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  45.56 
 
 
293 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  39.55 
 
 
281 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  39.11 
 
 
280 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  37.5 
 
 
288 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.7 
 
 
275 aa  172  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  42.15 
 
 
281 aa  169  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  38.15 
 
 
302 aa  168  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  38.15 
 
 
305 aa  168  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.45 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  37.72 
 
 
283 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  35 
 
 
341 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  34 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  33.55 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  39.03 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  33.88 
 
 
320 aa  145  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  34.33 
 
 
379 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  38.6 
 
 
281 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  34 
 
 
318 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  34 
 
 
318 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 
325 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  32.89 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  32.89 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  32.57 
 
 
324 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 
324 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  37.19 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.45 
 
 
320 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 
324 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 
324 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1348  HpcH/HpaI aldolase  42.59 
 
 
276 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  34.91 
 
 
276 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  34.23 
 
 
303 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  32.24 
 
 
323 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  35.84 
 
 
301 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  32.24 
 
 
325 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  35.53 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  33.92 
 
 
291 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  37.91 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  33.91 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.8 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  32.67 
 
 
318 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.8 
 
 
292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  37.1 
 
 
278 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.21 
 
 
289 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  36.14 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  31.86 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  33.09 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  34.13 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  34.2 
 
 
282 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.22 
 
 
296 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1194  HpcH/HpaI aldolase  36.12 
 
 
289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355955  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  35.99 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.04 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  35.79 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  34.4 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.45 
 
 
286 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.69 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  32.84 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.91 
 
 
292 aa  126  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  37.11 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2581  putative citrate lyase beta subunit  35.04 
 
 
278 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  36.86 
 
 
274 aa  125  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  31.38 
 
 
303 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  36.86 
 
 
274 aa  125  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.82 
 
 
271 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.09 
 
 
290 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  34.7 
 
 
270 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1878  HpcH/HpaI aldolase  36.62 
 
 
279 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  32.76 
 
 
293 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  33.94 
 
 
282 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  37.32 
 
 
283 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.22 
 
 
304 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2139  HpcH/HpaI aldolase  37.99 
 
 
290 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.747659  decreased coverage  0.00493167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  34.55 
 
 
274 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.911423 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.3 
 
 
306 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.3 
 
 
306 aa  122  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.2 
 
 
270 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.64 
 
 
279 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  30.77 
 
 
338 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  34.69 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  33.21 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.82 
 
 
289 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.51 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  30.14 
 
 
291 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  29.97 
 
 
321 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  30.07 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>