More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3663 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  94.43 
 
 
324 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
323 aa  665    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  94.43 
 
 
324 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  94.43 
 
 
324 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  92.88 
 
 
323 aa  625  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  92.83 
 
 
324 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  81.93 
 
 
325 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  82.55 
 
 
327 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  79.13 
 
 
325 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  63.78 
 
 
325 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  67.42 
 
 
320 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  62.26 
 
 
310 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  57.37 
 
 
318 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  57.37 
 
 
318 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  57.05 
 
 
341 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  56.11 
 
 
379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  56.74 
 
 
318 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  55.94 
 
 
320 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  54.01 
 
 
318 aa  346  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  59.82 
 
 
316 aa  343  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  43.81 
 
 
316 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  41.9 
 
 
303 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  46.15 
 
 
313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  46.15 
 
 
313 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  44.27 
 
 
338 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  41.96 
 
 
317 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  43.79 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  42.5 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  43.31 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  45.83 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  44.95 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  43.91 
 
 
315 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  42.36 
 
 
318 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  43.18 
 
 
321 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  42.36 
 
 
318 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  40.59 
 
 
312 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  38.71 
 
 
303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  42.04 
 
 
319 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  41.67 
 
 
318 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  42.18 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  40.66 
 
 
301 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  39.56 
 
 
319 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  37.46 
 
 
346 aa  205  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 
351 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  39.3 
 
 
349 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  38.63 
 
 
327 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  38.8 
 
 
336 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  38.63 
 
 
327 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  36.77 
 
 
363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  39.65 
 
 
349 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  39.65 
 
 
349 aa  199  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  39.65 
 
 
349 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  38.54 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  38.34 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  36.33 
 
 
371 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  37.66 
 
 
318 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  38.29 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 
355 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 
347 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  36.27 
 
 
350 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  34.28 
 
 
349 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  36.12 
 
 
292 aa  172  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.12 
 
 
292 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  36.22 
 
 
293 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.5 
 
 
406 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  32.24 
 
 
289 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.48 
 
 
294 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.96 
 
 
285 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.18 
 
 
296 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.7 
 
 
285 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  36.98 
 
 
286 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.35 
 
 
269 aa  159  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.7 
 
 
285 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  34.2 
 
 
287 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.24 
 
 
294 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.91 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  35.27 
 
 
301 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.12 
 
 
292 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.14 
 
 
271 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  36.18 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  33.33 
 
 
313 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  33.55 
 
 
292 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  34.43 
 
 
296 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  32.06 
 
 
292 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.43 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  31.09 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  34.54 
 
 
294 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.59 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  30.59 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.59 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  31.96 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  33.44 
 
 
296 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.54 
 
 
283 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  33.44 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.77 
 
 
292 aa  145  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  32.03 
 
 
295 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  30.16 
 
 
284 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  33 
 
 
297 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>