More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1085 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
306 aa  625  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  79.08 
 
 
306 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  78.43 
 
 
306 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  46.58 
 
 
296 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  46.88 
 
 
291 aa  265  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  46.18 
 
 
301 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  45.83 
 
 
291 aa  254  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  46.18 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  45.83 
 
 
291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  46.64 
 
 
291 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  45.68 
 
 
292 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  44.67 
 
 
304 aa  251  1e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  43.25 
 
 
290 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  45.68 
 
 
292 aa  249  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  41.07 
 
 
294 aa  248  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  44.06 
 
 
293 aa  246  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  41.83 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  43.94 
 
 
302 aa  238  9e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  41.81 
 
 
289 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  44.24 
 
 
289 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  44.24 
 
 
289 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  44.24 
 
 
289 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  44.24 
 
 
289 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.25 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.25 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  43.25 
 
 
302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  43.25 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  43.88 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  43.25 
 
 
302 aa  231  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  42.61 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  42.61 
 
 
282 aa  206  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  37.5 
 
 
284 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4207  Citryl-CoA lyase  40.69 
 
 
234 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  35.82 
 
 
282 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  36.49 
 
 
282 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  35.92 
 
 
292 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.41 
 
 
315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  36.43 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  32.9 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  36.69 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  37.37 
 
 
312 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  32.14 
 
 
295 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.55 
 
 
286 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  37.33 
 
 
304 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  35.17 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  35.94 
 
 
313 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  33.66 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  34.84 
 
 
316 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35.12 
 
 
313 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  33.33 
 
 
338 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  34.78 
 
 
318 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  36.64 
 
 
319 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.17 
 
 
324 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  31.09 
 
 
323 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  35.67 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.17 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.17 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  34.93 
 
 
331 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  31.73 
 
 
292 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  31.33 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  34.22 
 
 
321 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  31.37 
 
 
292 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.86 
 
 
286 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  31.31 
 
 
323 aa  143  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  31.79 
 
 
271 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2314  citrate (pro-3S)-lyase  38.52 
 
 
289 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.4 
 
 
269 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.47 
 
 
320 aa  142  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  32.86 
 
 
275 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  31.94 
 
 
327 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  33.55 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  31.33 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  34.49 
 
 
288 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  34.11 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.13 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  34.62 
 
 
288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.66 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  29.6 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  34.88 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  35.89 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  29.24 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.4 
 
 
274 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  33 
 
 
290 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  32.1 
 
 
292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  29.6 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  32.62 
 
 
275 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  29.52 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  32.68 
 
 
325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  34.01 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  31.97 
 
 
319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>