More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2830 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
304 aa  594  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  48.17 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  47.49 
 
 
303 aa  272  6e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  45.42 
 
 
324 aa  262  6e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  44.63 
 
 
323 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  45.39 
 
 
313 aa  258  6e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  48.32 
 
 
316 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  44.44 
 
 
323 aa  255  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  43.87 
 
 
324 aa  255  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  46.03 
 
 
338 aa  254  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  43.87 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  43.87 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  45.07 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  43.59 
 
 
325 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  47.35 
 
 
315 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  43.83 
 
 
325 aa  249  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  43.89 
 
 
321 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  47.54 
 
 
312 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  45.1 
 
 
325 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  44.37 
 
 
317 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  43.79 
 
 
327 aa  245  6e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  44.59 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  44.79 
 
 
331 aa  244  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  44.98 
 
 
320 aa  243  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  43.33 
 
 
301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  44.08 
 
 
318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  42.9 
 
 
316 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  47.19 
 
 
319 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  47.28 
 
 
310 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  46.69 
 
 
318 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  44.37 
 
 
319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  42.67 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  44.52 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  46.05 
 
 
318 aa  232  6e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  42.11 
 
 
341 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  42.47 
 
 
303 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  41.86 
 
 
318 aa  229  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  44.74 
 
 
336 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  44.74 
 
 
327 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  44.74 
 
 
327 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  41.33 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  41.45 
 
 
318 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  41.16 
 
 
320 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  40.86 
 
 
318 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  40.86 
 
 
318 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  45.7 
 
 
316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  44.4 
 
 
282 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  40.6 
 
 
293 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  42.03 
 
 
292 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.54 
 
 
294 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  42.03 
 
 
292 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  37.33 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  36.61 
 
 
282 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  35 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  39.86 
 
 
285 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  39.6 
 
 
292 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  42.62 
 
 
286 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  39.86 
 
 
285 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  39.13 
 
 
306 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  43.11 
 
 
301 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  38.67 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  38.51 
 
 
285 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  38.49 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  35.16 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  35.79 
 
 
291 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  37.92 
 
 
292 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  36.12 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  36.58 
 
 
292 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  36.45 
 
 
406 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  39.72 
 
 
279 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  32.88 
 
 
284 aa  159  7e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  39.25 
 
 
294 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.9 
 
 
304 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  37.16 
 
 
301 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.16 
 
 
301 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  37.16 
 
 
301 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  37.16 
 
 
301 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.16 
 
 
301 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  37.16 
 
 
301 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  34.11 
 
 
291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  36.79 
 
 
291 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.82 
 
 
301 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  38.05 
 
 
292 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  33.66 
 
 
290 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  34.35 
 
 
349 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 
350 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  33.9 
 
 
287 aa  153  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  34.02 
 
 
347 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  36.91 
 
 
286 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  37.92 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  33.68 
 
 
347 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  34.25 
 
 
349 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  34.25 
 
 
349 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  39.2 
 
 
331 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  33.44 
 
 
301 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  32.44 
 
 
291 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  32.99 
 
 
350 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  34.25 
 
 
349 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.08 
 
 
269 aa  150  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  34.59 
 
 
349 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>