More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2561 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
331 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  44.52 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  41.51 
 
 
327 aa  252  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  43.79 
 
 
323 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  44.26 
 
 
303 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  43.46 
 
 
324 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  43.46 
 
 
324 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  43.46 
 
 
324 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  43.09 
 
 
324 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  41.9 
 
 
320 aa  245  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  42.02 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  42.43 
 
 
325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  43.81 
 
 
312 aa  243  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  42.95 
 
 
323 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  41.39 
 
 
325 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  45.15 
 
 
313 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  43.54 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  40.98 
 
 
325 aa  239  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  43.48 
 
 
318 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  43.88 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  45.61 
 
 
313 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  43.61 
 
 
338 aa  238  9e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  43.96 
 
 
316 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  40.75 
 
 
303 aa  235  7e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  44.79 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  42.47 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  43.34 
 
 
321 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  43.18 
 
 
316 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  42.71 
 
 
317 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  45.05 
 
 
315 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  41.69 
 
 
318 aa  229  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  43.64 
 
 
321 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  40.19 
 
 
320 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  43.48 
 
 
318 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  43.48 
 
 
318 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  40.45 
 
 
318 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  40.45 
 
 
318 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  40.13 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  42.24 
 
 
327 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  42.24 
 
 
336 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  42.24 
 
 
327 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  42.38 
 
 
319 aa  223  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  45.08 
 
 
312 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  44.01 
 
 
318 aa  222  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  39.16 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  40.14 
 
 
301 aa  209  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  38.87 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  39.25 
 
 
293 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.83 
 
 
294 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.53 
 
 
286 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  33.56 
 
 
284 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.57 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.81 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  32.6 
 
 
350 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.23 
 
 
285 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  33.02 
 
 
349 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 
349 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 
349 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  36.62 
 
 
301 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.23 
 
 
285 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  32.91 
 
 
349 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  33.65 
 
 
349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  33.9 
 
 
269 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  32.49 
 
 
349 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.04 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  31.51 
 
 
371 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  33.22 
 
 
306 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.31 
 
 
291 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  35.54 
 
 
304 aa  152  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  32.27 
 
 
346 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.8 
 
 
292 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.44 
 
 
292 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  31.85 
 
 
290 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.44 
 
 
292 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.23 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  31.21 
 
 
287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  31.97 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  32.54 
 
 
291 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  35.17 
 
 
306 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.46 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  32.65 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.6 
 
 
283 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  35.14 
 
 
292 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.11 
 
 
295 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 
291 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  32.23 
 
 
351 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.11 
 
 
302 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  31.91 
 
 
284 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.11 
 
 
302 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.11 
 
 
302 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.08 
 
 
282 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  34.48 
 
 
306 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.11 
 
 
302 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  34.01 
 
 
291 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.44 
 
 
271 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.04 
 
 
406 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.11 
 
 
302 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.65 
 
 
289 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.65 
 
 
289 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.65 
 
 
289 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>