More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1370 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
293 aa  585  1e-166  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  51.6 
 
 
292 aa  277  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  51.25 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  48.07 
 
 
294 aa  271  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  45.45 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  48.76 
 
 
282 aa  248  9e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  43.66 
 
 
304 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  44.06 
 
 
306 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  45.1 
 
 
290 aa  244  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  44.41 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  43.36 
 
 
291 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  44.06 
 
 
291 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  43.36 
 
 
301 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  43.99 
 
 
291 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  43.36 
 
 
291 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  42.31 
 
 
306 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  42.11 
 
 
289 aa  231  7.000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  41.28 
 
 
289 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  41.28 
 
 
289 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  41.28 
 
 
289 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  41.28 
 
 
289 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  44.76 
 
 
406 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  42.11 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  40.93 
 
 
289 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  42.91 
 
 
306 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  41.75 
 
 
302 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  42.56 
 
 
306 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  42.11 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  36.3 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  43.43 
 
 
298 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  40.14 
 
 
286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  37.59 
 
 
295 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  36.86 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  39.25 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  39.22 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  42.86 
 
 
297 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  36.54 
 
 
324 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  40.6 
 
 
304 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  36.54 
 
 
324 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  36.22 
 
 
323 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  42.91 
 
 
297 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  36.93 
 
 
295 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  36.11 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  34.02 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  37.42 
 
 
320 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  35.9 
 
 
323 aa  165  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  36.01 
 
 
324 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  36.65 
 
 
292 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  37.67 
 
 
288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  37.25 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  37.86 
 
 
292 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  38.64 
 
 
286 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  36.3 
 
 
302 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  38.97 
 
 
303 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  36.24 
 
 
295 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  41.4 
 
 
289 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.93 
 
 
292 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  38.49 
 
 
298 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  36.01 
 
 
313 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  35.42 
 
 
292 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  36.64 
 
 
330 aa  157  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  34.82 
 
 
325 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  42.61 
 
 
297 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  36.4 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  35.09 
 
 
285 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  37.72 
 
 
308 aa  155  9e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.09 
 
 
285 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  37.02 
 
 
290 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  34.78 
 
 
316 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  34.78 
 
 
292 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.68 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  33.79 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  34.46 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 
296 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  37.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  37.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  37.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  38.46 
 
 
277 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  34.04 
 
 
287 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 
296 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.03 
 
 
294 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  37.59 
 
 
279 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  35.09 
 
 
291 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  33.68 
 
 
292 aa  149  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  35.15 
 
 
291 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  33.8 
 
 
282 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>