More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3189 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 301 aa  601  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  44.48 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  41.2 
 
 		 313 aa  228  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  42.36 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  43.33 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  40.72 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  40.33 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  40.72 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  40.72 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  40.52 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  40.66 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  40.13 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  41.35 
 
 		 327 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  38.54 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  40.75 
 
 		 338 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  39.87 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  38.94 
 
 		 324 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  39.62 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  38.76 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  39.4 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  37.62 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  39.79 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  38.89 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  37.17 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  38.44 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  39.79 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  39.87 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  42.12 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  39.04 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  39.8 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  38.11 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  36.84 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  38.01 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  38.01 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  38.01 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  38.28 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.07 
 
 		 294 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  37.59 
 
 		 318 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  36.12 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  36.12 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.14 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.14 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  39.08 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35.81 
 
 		 379 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  40.13 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  35.14 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  35.14 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  35.79 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  42.14 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.02 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  33.44 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  35.29 
 
 		 282 aa  159  7e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.08 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.21 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  37.89 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  36 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  35.03 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  34.23 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  36.23 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.92 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.18 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.92 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  34.78 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2235  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.27 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.83 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.84 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  35.84 
 
 		 280 aa  136  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.92 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  30.1 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  30.27 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.81 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  30.72 
 
 		 363 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.75 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.75 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  32.75 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.75 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.81 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  34.26 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.81 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  32.13 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.81 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 		 330 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.29 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  30.42 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  35.23 
 
 		 283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  29.74 
 
 		 346 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  30.88 
 
 		 290 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.72 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  29.66 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.72 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.72 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  30.72 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  29.87 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>