More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0816 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
287 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  66.91 
 
 
295 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  62.32 
 
 
285 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  62.68 
 
 
285 aa  348  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  62.68 
 
 
285 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  59.79 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  61.25 
 
 
279 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  50.36 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  51.76 
 
 
313 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  50.18 
 
 
286 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  50.35 
 
 
303 aa  249  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  48.46 
 
 
298 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  50.53 
 
 
300 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  45.83 
 
 
296 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  46.53 
 
 
292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  45.49 
 
 
296 aa  241  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  45.49 
 
 
296 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  43.55 
 
 
292 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  49.82 
 
 
300 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  48.57 
 
 
292 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  42.07 
 
 
292 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  46.58 
 
 
292 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  42.86 
 
 
292 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  51.94 
 
 
297 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  44.48 
 
 
292 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  51.92 
 
 
297 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  47.04 
 
 
293 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  46.81 
 
 
331 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  45.07 
 
 
294 aa  222  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  49.83 
 
 
289 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  44.37 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  46.15 
 
 
294 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  45.39 
 
 
291 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  41.52 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  41.79 
 
 
292 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  51.57 
 
 
297 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  42.11 
 
 
297 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  42.09 
 
 
277 aa  205  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  42.96 
 
 
311 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  42.29 
 
 
282 aa  198  9e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  42.01 
 
 
302 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  43.26 
 
 
301 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  44 
 
 
299 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  43.77 
 
 
325 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.81 
 
 
294 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  43.56 
 
 
267 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  35.5 
 
 
323 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.59 
 
 
302 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.59 
 
 
302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.59 
 
 
302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.23 
 
 
302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  34.2 
 
 
323 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  35.97 
 
 
286 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.7 
 
 
296 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.23 
 
 
302 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  33.23 
 
 
324 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  34.64 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.82 
 
 
276 aa  152  5e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.73 
 
 
285 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  32.36 
 
 
327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.9 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  33.8 
 
 
291 aa  152  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.9 
 
 
324 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.04 
 
 
293 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.9 
 
 
324 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  32.58 
 
 
379 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.29 
 
 
292 aa  149  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  34.42 
 
 
290 aa  148  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.29 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  32.26 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  32.26 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.88 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  30 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.26 
 
 
320 aa  145  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.54 
 
 
290 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.48 
 
 
269 aa  144  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  34.66 
 
 
282 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  35.17 
 
 
316 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.27 
 
 
325 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  32.03 
 
 
318 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  30.62 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.52 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  31.58 
 
 
341 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  31.61 
 
 
325 aa  139  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  32.42 
 
 
303 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.85 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  30.85 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.85 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  30.85 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  32.17 
 
 
291 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  32.17 
 
 
291 aa  138  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  31.76 
 
 
313 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>