More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5000 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 292 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  59.65 
 
 		 300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  54.88 
 
 		 298 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  53.04 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  53.04 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  50.9 
 
 		 292 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  54.27 
 
 		 294 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  52.36 
 
 		 296 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  48.42 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  49.65 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  52.45 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  53.55 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  51.94 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  50.35 
 
 		 292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  57.71 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  51.58 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  50 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  59.14 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  50.87 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  48.6 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  48.92 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  48.57 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  49.48 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  48.43 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  49.13 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  47.39 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  47.02 
 
 		 291 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  50.51 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  47.08 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  46.04 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  56.03 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  46.9 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  55.24 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  47.04 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  52.6 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  45.17 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  54.9 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  44.14 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  42.01 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  43.48 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  42.7 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  41.87 
 
 		 302 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  40.64 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  38.08 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.86 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  30.31 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  34.92 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  34.08 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  34.29 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  33.55 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.6 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.49 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  34.83 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  41.76 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.7 
 
 		 324 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.7 
 
 		 324 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.82 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.39 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.82 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  34.09 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  34.97 
 
 		 282 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  34.19 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  30.11 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  35.44 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.85 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  32.28 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.06 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  33.87 
 
 		 379 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  29.62 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.17 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  34.1 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.17 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.17 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.82 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  33 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  30.8 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 		 319 aa  129  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  33.55 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  33.55 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  33.92 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.06 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.71 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.71 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.71 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  34.04 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.71 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  34.2 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.82 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  35.71 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  32.7 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  30.88 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  33.01 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  34.47 
 
 		 312 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  33.92 
 
 		 274 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>