More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0233 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 300 aa  588  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  59.57 
 
 		 292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  49.65 
 
 		 292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  48.19 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  51.76 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  49.3 
 
 		 292 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  51.05 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  47.72 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  48.42 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  50.52 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  48.42 
 
 		 296 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  53.26 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  50.18 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  47.74 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  50.53 
 
 		 287 aa  248  8e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  49.47 
 
 		 285 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  49.12 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  47.46 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  45.62 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  50.36 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  49.3 
 
 		 284 aa  242  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  47.7 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  49.27 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  46.81 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  47.02 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  45.96 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  46.98 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  48.07 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  53.41 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  48.4 
 
 		 331 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  46.29 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  48.07 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  50.88 
 
 		 289 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  52.65 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  47.21 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  47.72 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  44.91 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  48.25 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  51.79 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  52.65 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  44.8 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  43.97 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  42.5 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.15 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  36.08 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  43.07 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  36.43 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  41.87 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  41.87 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  41.87 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  41.87 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  41.87 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  41.87 
 
 		 301 aa  145  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  41.52 
 
 		 301 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  36.46 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.11 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2235  citrate lyase, beta subunit  38.3 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.82 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  35.03 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  35.96 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  34.83 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.23 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  38.51 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  32.03 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.84 
 
 		 323 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  30.87 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  38.57 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  34.67 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.75 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  31.61 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  31.19 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  30.97 
 
 		 320 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  32.59 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  32.59 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  30.42 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  30.42 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  30.84 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  25.52 
 
 		 284 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  27.78 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  30.1 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  34.01 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  32.2 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  32.99 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.28 
 
 		 283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  36.07 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  32.98 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  31.29 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  37.28 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  31.79 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  28.87 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  34.1 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  31.48 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.41 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  31.48 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  35.64 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  30.79 
 
 		 331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  31.25 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  31.82 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>