More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2882 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  45.65 
 
 
285 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  45.65 
 
 
285 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  45.13 
 
 
284 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  45.45 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  46.95 
 
 
291 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  46.48 
 
 
331 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  44.8 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  43.37 
 
 
287 aa  212  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  44.01 
 
 
297 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  46.74 
 
 
294 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  44.96 
 
 
292 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  44.01 
 
 
292 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  43.87 
 
 
279 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  46.38 
 
 
294 aa  205  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  43.12 
 
 
296 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  43.48 
 
 
296 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  44.04 
 
 
286 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  42.39 
 
 
295 aa  202  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  43.48 
 
 
296 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  43.97 
 
 
311 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  45.94 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  45.16 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  43.73 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  43.17 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  43.43 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  43.93 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  42.75 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  45.59 
 
 
277 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  48 
 
 
299 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  42.25 
 
 
292 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  44.72 
 
 
292 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  43.43 
 
 
303 aa  192  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  45.05 
 
 
300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  42.2 
 
 
297 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  44.4 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  44.09 
 
 
293 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  43.16 
 
 
302 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  39.72 
 
 
308 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  41.94 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  48.52 
 
 
289 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  47.46 
 
 
297 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  38.63 
 
 
296 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  46.38 
 
 
297 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  47.62 
 
 
267 aa  148  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  36.24 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.04 
 
 
294 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  34.39 
 
 
282 aa  142  5e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  46.01 
 
 
297 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.58 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  31.82 
 
 
324 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  30.67 
 
 
320 aa  136  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  36.96 
 
 
274 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  29.18 
 
 
284 aa  136  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  36.96 
 
 
274 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.21 
 
 
302 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  31.49 
 
 
323 aa  135  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  31.49 
 
 
323 aa  135  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  33.45 
 
 
310 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.17 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  34.48 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.85 
 
 
269 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  34.15 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.86 
 
 
302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.86 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.86 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.86 
 
 
302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  31.6 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  31.6 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.86 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  35.97 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.92 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  33.1 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.38 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.51 
 
 
302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  34.25 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  34.25 
 
 
336 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  34.25 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  31.45 
 
 
271 aa  129  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.44 
 
 
292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 
271 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  36.4 
 
 
292 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.44 
 
 
292 aa  126  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  30.94 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.6 
 
 
325 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  34.48 
 
 
318 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  36.33 
 
 
282 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  31.92 
 
 
325 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  31.41 
 
 
276 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
316 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  30.66 
 
 
288 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  35.84 
 
 
293 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>