More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0181 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
297 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  95.93 
 
 
297 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  96.52 
 
 
297 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  77.35 
 
 
289 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  57.04 
 
 
292 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  63.03 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  60.28 
 
 
286 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  55.67 
 
 
313 aa  285  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  54.33 
 
 
284 aa  281  8.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  54.39 
 
 
298 aa  278  7e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  52.61 
 
 
287 aa  276  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  52.23 
 
 
296 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  55.32 
 
 
285 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  52.23 
 
 
296 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  52.23 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  54.96 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  52.08 
 
 
292 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  52.78 
 
 
297 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  54.3 
 
 
294 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  49.13 
 
 
292 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  55.87 
 
 
292 aa  265  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  47.39 
 
 
292 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  52.13 
 
 
285 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  49.64 
 
 
292 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  52.75 
 
 
295 aa  258  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  52.07 
 
 
292 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  54.24 
 
 
279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  49.48 
 
 
292 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  52.67 
 
 
294 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  51.94 
 
 
300 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  56.21 
 
 
293 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  52.69 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  49.65 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  48.94 
 
 
291 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  48.57 
 
 
292 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  51.75 
 
 
277 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  48.4 
 
 
308 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  51.96 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  43.06 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  45.8 
 
 
301 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.79 
 
 
294 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  43.86 
 
 
302 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  42.86 
 
 
293 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  42.01 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  47.1 
 
 
282 aa  190  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  41.64 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  42.66 
 
 
299 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  36.33 
 
 
296 aa  178  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  41.4 
 
 
292 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.25 
 
 
302 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  38.25 
 
 
302 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  41.4 
 
 
292 aa  175  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.25 
 
 
302 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.25 
 
 
302 aa  175  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.73 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.73 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  38.73 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.73 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  39.08 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  37.89 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  37.89 
 
 
302 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  38.57 
 
 
313 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  42.42 
 
 
318 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  39.35 
 
 
306 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  37.19 
 
 
304 aa  168  8e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  39.39 
 
 
313 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  38.28 
 
 
290 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  40.13 
 
 
315 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  33.09 
 
 
284 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  38.69 
 
 
317 aa  166  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  39.47 
 
 
319 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  41.34 
 
 
286 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  37.41 
 
 
301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  37.46 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  36.4 
 
 
291 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  40.91 
 
 
318 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.25 
 
 
269 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  37.55 
 
 
321 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  36.64 
 
 
318 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  36.64 
 
 
318 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  37.1 
 
 
291 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  37.05 
 
 
291 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  46.64 
 
 
267 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  39.52 
 
 
290 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  35.89 
 
 
291 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  39.16 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.21 
 
 
289 aa  155  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  39.03 
 
 
406 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  34.41 
 
 
324 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  39.92 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  39.92 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  34.85 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>