More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0067 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  99.31 
 
 		 289 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  74.13 
 
 		 291 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  75.17 
 
 		 301 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  75.87 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  73.01 
 
 		 290 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  73.43 
 
 		 291 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  73.78 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  65.73 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  63.1 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.45 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  63.45 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  63.1 
 
 		 302 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  63.1 
 
 		 302 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  56.25 
 
 		 296 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  54.42 
 
 		 304 aa  295  8e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  44.6 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  44.24 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  44.6 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  41.28 
 
 		 293 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  44.6 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  45.16 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  45.16 
 
 		 306 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  40.64 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  39.21 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  38.46 
 
 		 406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  35.07 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  36.17 
 
 		 295 aa  161  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  37.94 
 
 		 298 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  37.05 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  34.55 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35.23 
 
 		 284 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  34.74 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  36.4 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  34.04 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  36.24 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.21 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  35 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  35.31 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.51 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.44 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.01 
 
 		 292 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  32.67 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.57 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  34.64 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  34.98 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  32.14 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  31.97 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  34.84 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  30.85 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  32.67 
 
 		 379 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.29 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  34.63 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.07 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.27 
 
 		 283 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  33.11 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  33.22 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  33.93 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  34.04 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  31.67 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  31.72 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  33.22 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  33.83 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  31.67 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  31.65 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  35.19 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  33.33 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  33.57 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.46 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.22 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  35.4 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  33.92 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  33.22 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  32.3 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  31.05 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  39.08 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  31.62 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  33.81 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  38.73 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  31.62 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  34.51 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  30.39 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  30.72 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  33.68 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  31.91 
 
 		 282 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  34.04 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>