More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3299 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 291 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  86.94 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  53.9 
 
 		 292 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  55.67 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  51.42 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  51.07 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  55.09 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  52.48 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  51.79 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  54.8 
 
 		 297 aa  278  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  53.76 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  50.36 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  50.53 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  50.71 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  47.16 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  47.14 
 
 		 296 aa  245  6e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  47.14 
 
 		 296 aa  245  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  46.79 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  51.42 
 
 		 300 aa  242  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  52.31 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  49.82 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  46.79 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  46.98 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  47.86 
 
 		 313 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  47.02 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  46.15 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  45.45 
 
 		 285 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  46.79 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  45.45 
 
 		 285 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  48.19 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  45.39 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  45.2 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  44.09 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  45.55 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  46.59 
 
 		 282 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  41.75 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  43.66 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  49.29 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  47.55 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  48.94 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  48.06 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  41.96 
 
 		 308 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  48.94 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  43.62 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  39.86 
 
 		 302 aa  172  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  40.28 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  40.28 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  38.59 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  39.93 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.58 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.59 
 
 		 289 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.24 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.24 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.24 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.24 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  38.19 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.75 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  38.36 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  34.86 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  35.89 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  35.64 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  36.88 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35.97 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  35.99 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  36.07 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.49 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  35.83 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  37.29 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  36.49 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  34.71 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  35.64 
 
 		 291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  35.08 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  34.64 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  33.55 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  30.99 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  36.91 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  33.66 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  33.65 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  34.11 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  37.37 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  35.92 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.22 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  32.35 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  32.12 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  33.02 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  34.14 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  32.35 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  35.97 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.1 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  36.07 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>