More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4030 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  100 
 
 		 321 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 316 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  88.54 
 
 		 338 aa  578  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  78.53 
 
 		 318 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  77.24 
 
 		 318 aa  500  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  76.68 
 
 		 321 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  75.32 
 
 		 317 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  69.11 
 
 		 313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  71.7 
 
 		 319 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  68.05 
 
 		 313 aa  432  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  68.79 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  66.45 
 
 		 312 aa  413  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  66.56 
 
 		 318 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  63.06 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  63.06 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  63.06 
 
 		 327 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  64.01 
 
 		 318 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  61.98 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  60.7 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  57.38 
 
 		 312 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  45.33 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  45.08 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  44.55 
 
 		 316 aa  245  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  43.35 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  43.95 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  43.31 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  43.04 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  43.04 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  43.31 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  43.09 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  42.63 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  42.45 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  43.96 
 
 		 331 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  41.39 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  44.18 
 
 		 310 aa  222  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  42.9 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  42.39 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  43.23 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  45.64 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  41.45 
 
 		 341 aa  205  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  41.37 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  38.76 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  40.2 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  40.07 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  39.42 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  40.2 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  39.8 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  40.64 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  33.33 
 
 		 363 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  34.49 
 
 		 355 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  34.17 
 
 		 346 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  33.75 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  33.23 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  33.75 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.84 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  33.54 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  33.12 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  33.97 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  33.02 
 
 		 349 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  33.14 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.12 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  33.22 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.57 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  32.81 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.99 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  33 
 
 		 292 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  34.64 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.01 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  33.98 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.45 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.45 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.45 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.18 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.45 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.45 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  30.72 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  31.34 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  31.46 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  31.58 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  32.78 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  30.41 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  35.18 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  34.22 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  34.65 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  30.09 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  31.65 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  32.28 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  31.6 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  32.95 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  35.34 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  30.26 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>