More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2212 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
269 aa  537  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  57.52 
 
 
271 aa  320  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  36.27 
 
 
303 aa  174  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  34.48 
 
 
303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.24 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.24 
 
 
324 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.24 
 
 
324 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  31.91 
 
 
324 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  31.68 
 
 
327 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  31.91 
 
 
323 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.35 
 
 
323 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  31.91 
 
 
320 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.92 
 
 
292 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  35.29 
 
 
316 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  35.06 
 
 
285 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.59 
 
 
285 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.59 
 
 
285 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.28 
 
 
294 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  31.88 
 
 
341 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 
313 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  30.03 
 
 
325 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  32.43 
 
 
318 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  31.75 
 
 
286 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  35.66 
 
 
292 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 
292 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  31.29 
 
 
313 aa  149  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  32.74 
 
 
292 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  32.76 
 
 
313 aa  149  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  34.89 
 
 
284 aa  148  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  33.79 
 
 
312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  34.17 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  31.65 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  30.07 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  30.07 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  30.41 
 
 
379 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  34.25 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  32.21 
 
 
318 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  31.58 
 
 
292 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  31.48 
 
 
287 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.75 
 
 
306 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
318 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.75 
 
 
306 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  32.75 
 
 
297 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  32.08 
 
 
310 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  33.68 
 
 
318 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  30.03 
 
 
325 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  31.85 
 
 
284 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  30.32 
 
 
325 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.4 
 
 
306 aa  142  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  32.19 
 
 
315 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  33.45 
 
 
318 aa  142  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  32.12 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  30.8 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  31.9 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  31.42 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.88 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  32.27 
 
 
292 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  33.56 
 
 
336 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  34.83 
 
 
318 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
327 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  34.26 
 
 
318 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
327 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  31.25 
 
 
321 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  33.92 
 
 
288 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 
319 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  32.08 
 
 
277 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  32.47 
 
 
286 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  32.52 
 
 
291 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  32.99 
 
 
316 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  29.01 
 
 
312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.63 
 
 
330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  30.71 
 
 
301 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  33.59 
 
 
271 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  29.68 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  31.79 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  30.85 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  30.21 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  32 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  32.36 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.15 
 
 
282 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  30.47 
 
 
296 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  30.39 
 
 
294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  31.65 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.91 
 
 
293 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  30.47 
 
 
296 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  32.4 
 
 
321 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  32.06 
 
 
282 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  31.08 
 
 
304 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  29.62 
 
 
294 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  28.57 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  31.09 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  30 
 
 
291 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  30.71 
 
 
296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  31.6 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  30.64 
 
 
323 aa  129  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  30.8 
 
 
338 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  31.88 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  32.13 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>