More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0539 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  100 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  52.96 
 
 		 303 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  59.3 
 
 		 289 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  51.37 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  51.56 
 
 		 285 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  51.76 
 
 		 286 aa  285  5.999999999999999e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  51.56 
 
 		 285 aa  285  9e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  49.65 
 
 		 287 aa  278  7e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  50.18 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  56.45 
 
 		 297 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  57.09 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  48.59 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  48.52 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  48.36 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  47.57 
 
 		 292 aa  261  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  48.26 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  48.42 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  56.1 
 
 		 297 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  47.72 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  43.6 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  47.37 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  49.65 
 
 		 292 aa  248  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  48.1 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  44.64 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  46.1 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  48.44 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  48.74 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  46.02 
 
 		 292 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  48.59 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  50.54 
 
 		 300 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  42.6 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  48.07 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  43.32 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  43.45 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  45.71 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  42.01 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  42.29 
 
 		 308 aa  201  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  41.94 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  42.75 
 
 		 277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  40.14 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  42.31 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  41.75 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.85 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  42.45 
 
 		 282 aa  186  6e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  42.34 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  35.09 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  35.02 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  38.54 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.69 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.34 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.34 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.34 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  38.03 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  35.42 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.21 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  33.81 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.98 
 
 		 302 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.49 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  36.69 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.19 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  37.19 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  36.51 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35.45 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.19 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.19 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  36.21 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  36.03 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  34.77 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  42.05 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  34.55 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  35.19 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  36.93 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  34.89 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  34.34 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  35.79 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  35.79 
 
 		 336 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  35.79 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  34.88 
 
 		 316 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  35.57 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  32.67 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  33.65 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  35.1 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  34.45 
 
 		 341 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  34.3 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  34.44 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  35.29 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  36.84 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  34.52 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  34.77 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>