More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4487 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 318 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  89.91 
 
 		 318 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  82.39 
 
 		 336 aa  540  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  82.39 
 
 		 327 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  82.39 
 
 		 327 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  71.9 
 
 		 319 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  66.56 
 
 		 313 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  67.41 
 
 		 338 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  66.56 
 
 		 318 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  64.54 
 
 		 317 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  65.61 
 
 		 318 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  64.65 
 
 		 313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  67.73 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  64.01 
 
 		 316 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  63.4 
 
 		 321 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  64.08 
 
 		 321 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  62.9 
 
 		 319 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  64.1 
 
 		 315 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  62.42 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  53.82 
 
 		 312 aa  300  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  41.2 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  44.59 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  46.69 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  43.48 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  40.76 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  42.91 
 
 		 303 aa  212  7.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  38.8 
 
 		 325 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  43.97 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  38.92 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  38.91 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  37.97 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  38.24 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  38.61 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  38.29 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  41.16 
 
 		 320 aa  188  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  37.97 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  37.97 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  39.07 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  39.02 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  40.68 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  37.79 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  38.06 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  38.74 
 
 		 379 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  37.59 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  37.42 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  37.42 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  44.48 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  40.65 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  37.46 
 
 		 292 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  36.42 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  36.42 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  33.96 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  36.84 
 
 		 349 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  33.54 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  36.1 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  36.09 
 
 		 349 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  37.32 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.92 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  35.83 
 
 		 291 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  37.76 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  37.01 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.24 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  39.69 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  33.23 
 
 		 350 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  33.44 
 
 		 355 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  37.79 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  34.26 
 
 		 269 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  35.74 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.08 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  35.59 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  31.76 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.09 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  34.86 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  41.15 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  38.93 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  31.93 
 
 		 295 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  33.78 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  31.76 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  30.56 
 
 		 271 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  34.56 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  35.54 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  31.65 
 
 		 347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.71 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  41.15 
 
 		 297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  34.96 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  33.7 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  32.28 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.33 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.33 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  32.34 
 
 		 349 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  33.88 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  31.93 
 
 		 306 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  34.21 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.21 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 279 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.21 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>