More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2107 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  100 
 
 
296 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  96.96 
 
 
296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  96.62 
 
 
296 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  81.44 
 
 
297 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  76.03 
 
 
294 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  77.22 
 
 
294 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  56.64 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  55.03 
 
 
298 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  54.36 
 
 
313 aa  292  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  58.78 
 
 
300 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  52.52 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  50 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  49.3 
 
 
292 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  51.74 
 
 
292 aa  278  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  49.3 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  52.16 
 
 
292 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  50 
 
 
292 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  51.37 
 
 
293 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  52.82 
 
 
292 aa  259  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  47.72 
 
 
300 aa  258  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  51.1 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  49.46 
 
 
292 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  50 
 
 
303 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  47.39 
 
 
284 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  45.83 
 
 
287 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  48.24 
 
 
285 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  48.59 
 
 
285 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  47.14 
 
 
291 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  45.49 
 
 
295 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  47.42 
 
 
301 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  48.2 
 
 
331 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  45.49 
 
 
285 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  51.2 
 
 
297 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  48.16 
 
 
279 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  51.92 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  49.32 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  41.98 
 
 
311 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  50.86 
 
 
297 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  42.12 
 
 
302 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  48.91 
 
 
325 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  41.67 
 
 
282 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  40.55 
 
 
308 aa  179  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  40.29 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  40.59 
 
 
299 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.79 
 
 
294 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.09 
 
 
292 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  37.09 
 
 
292 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.79 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  34.43 
 
 
323 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.64 
 
 
296 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  34.43 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  34.1 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  34.74 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  33.88 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  34.1 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  34.1 
 
 
324 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  34.74 
 
 
301 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  34.15 
 
 
304 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  35.27 
 
 
317 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  35.44 
 
 
291 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  35.03 
 
 
313 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.65 
 
 
302 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.66 
 
 
302 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  32.12 
 
 
289 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.65 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.65 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  34.13 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  35.02 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  37.08 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.82 
 
 
284 aa  140  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  34.04 
 
 
291 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.36 
 
 
271 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  32.87 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  36.73 
 
 
312 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.31 
 
 
302 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 
306 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  34.68 
 
 
315 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  34.04 
 
 
291 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  29.6 
 
 
306 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.94 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  35.94 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.94 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  35.94 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  35.94 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  31.65 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  35.94 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  40.15 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.77 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.59 
 
 
301 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  33.58 
 
 
319 aa  135  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.77 
 
 
306 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  32.57 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  35.71 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  35.25 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.25 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  35.25 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.25 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.25 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  35.25 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>