More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4394 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  60.84 
 
 		 286 aa  332  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  56.94 
 
 		 313 aa  323  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  53.74 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  50 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  49.66 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  49.32 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  51.22 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  53.17 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  52.23 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  52.1 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  49.65 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  48.28 
 
 		 292 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  48.38 
 
 		 295 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  47.02 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  46.58 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  44.29 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  48.79 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  52.11 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  46.85 
 
 		 284 aa  239  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  48.44 
 
 		 285 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  46.85 
 
 		 285 aa  238  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  42.76 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  47.5 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  44.44 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  49.26 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  47.33 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  44.79 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  51.04 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  46.78 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  45.32 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  52.07 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  45.55 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  45.26 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  41.99 
 
 		 308 aa  215  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  52.46 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  46.26 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  42.96 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  51.72 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  42.25 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  40.21 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  42.96 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  43.46 
 
 		 325 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  41.67 
 
 		 299 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.4 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  36.3 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.79 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  31.23 
 
 		 296 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.92 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  36.3 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.79 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.79 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  44 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.79 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  37.5 
 
 		 306 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.56 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.43 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  35.07 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  33.1 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.36 
 
 		 302 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.62 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  34.88 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.74 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.74 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  34.52 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.83 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  33.11 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  34.98 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  35.46 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  32.79 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  31.51 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 317 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  29.62 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.4 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.4 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.4 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  36.49 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.4 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  33.57 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.04 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.6 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.47 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  31.4 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  31.4 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.54 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  34.68 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  28.32 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  32.89 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  32.77 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.02 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  31.79 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>