More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0325 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  77.19 
 
 
302 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  74.56 
 
 
306 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  75.44 
 
 
302 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  75.44 
 
 
302 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  75.44 
 
 
302 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  75.09 
 
 
302 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  74.48 
 
 
302 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  70.53 
 
 
291 aa  411  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  68.2 
 
 
301 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  68.29 
 
 
291 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  66.9 
 
 
291 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  66.9 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  65.73 
 
 
289 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  65.73 
 
 
289 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  65.73 
 
 
289 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  65.73 
 
 
289 aa  387  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  65.38 
 
 
289 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  61.84 
 
 
290 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  63.76 
 
 
296 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  55.79 
 
 
304 aa  302  4.0000000000000003e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  46.64 
 
 
306 aa  265  8e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  46.32 
 
 
294 aa  262  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  43.99 
 
 
293 aa  253  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  45.94 
 
 
306 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  45.58 
 
 
306 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  42.76 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  42.76 
 
 
292 aa  225  9e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  41.52 
 
 
289 aa  205  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  37.8 
 
 
406 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  37.68 
 
 
282 aa  192  4e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  36 
 
 
295 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  38.6 
 
 
286 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  34.32 
 
 
284 aa  169  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  33.8 
 
 
287 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4207  Citryl-CoA lyase  36.6 
 
 
234 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000486411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  37.45 
 
 
298 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  36.17 
 
 
285 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.46 
 
 
285 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  35.46 
 
 
285 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 
284 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  36.23 
 
 
279 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.94 
 
 
295 aa  152  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  35.61 
 
 
303 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  34.69 
 
 
298 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  34.13 
 
 
275 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  37.29 
 
 
291 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.68 
 
 
286 aa  148  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  34.97 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  31.73 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  31.73 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.04 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  32.38 
 
 
324 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.73 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  32.97 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  34.29 
 
 
313 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  32.05 
 
 
323 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  34.46 
 
 
316 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  32.62 
 
 
292 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  35.59 
 
 
338 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  31.41 
 
 
323 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  34.05 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  34.01 
 
 
331 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  32.55 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  36.55 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  31.29 
 
 
303 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  36.43 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
330 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  34.06 
 
 
298 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  35.07 
 
 
287 aa  139  7e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  36.04 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  33.81 
 
 
292 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35 
 
 
313 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  32.13 
 
 
301 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  32.6 
 
 
296 aa  137  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  32.27 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  32.6 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  31.09 
 
 
327 aa  136  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.82 
 
 
308 aa  136  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  34.63 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  33.93 
 
 
292 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  33.57 
 
 
313 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  32.01 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  31.47 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  34.04 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  32.08 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  32.76 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  35.86 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  31.56 
 
 
292 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  35.03 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  33.7 
 
 
297 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>