More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5195 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 315 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  80.91 
 
 		 318 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  72.76 
 
 		 313 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  73.87 
 
 		 313 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  73.31 
 
 		 319 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  72.9 
 
 		 312 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  70.97 
 
 		 321 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  68.89 
 
 		 317 aa  437  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  69.01 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  68.91 
 
 		 338 aa  424  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  68.37 
 
 		 318 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  68.79 
 
 		 316 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  68.51 
 
 		 321 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  63.67 
 
 		 319 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  64.01 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  64.01 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  63.69 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  64.01 
 
 		 327 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  64.1 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  56.86 
 
 		 312 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  45.98 
 
 		 325 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  43.32 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  45.51 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  43.63 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  43.91 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  43.59 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  45.61 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  43.59 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  43.31 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  43.31 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  47.35 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  42.36 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  44.75 
 
 		 310 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  42.09 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  42.76 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  45.05 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  42.07 
 
 		 327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  41.01 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  40.92 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  43.04 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  40.26 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  45.8 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  41 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  41 
 
 		 379 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  40.67 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  40.67 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  39.02 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  45.58 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  35.44 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  35.41 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  35.03 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  35.71 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  38.46 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  35.97 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.44 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  31.21 
 
 		 371 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  34.42 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  32.91 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  32.91 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  31.67 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  35.71 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  34.71 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  33.33 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  32.91 
 
 		 349 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.19 
 
 		 269 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.63 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  35.31 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  33.76 
 
 		 349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  32.37 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  36.31 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  37.79 
 
 		 285 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  34.68 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  36.3 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  35.83 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  36.3 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  31.99 
 
 		 349 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  32.99 
 
 		 346 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.17 
 
 		 284 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  31.55 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.34 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  35.74 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  37.54 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.55 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.79 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.55 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.82 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.55 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.55 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>