More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0731 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 349 aa  715    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  72.91 
 
 		 349 aa  524  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  71.06 
 
 		 350 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  71.06 
 
 		 371 aa  512  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  70.2 
 
 		 349 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  70.2 
 
 		 349 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  69.91 
 
 		 349 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  70.77 
 
 		 346 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  70.2 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  67.05 
 
 		 347 aa  481  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  66.38 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  66.19 
 
 		 347 aa  478  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  63.61 
 
 		 351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  60.34 
 
 		 363 aa  421  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  58.97 
 
 		 355 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  38.82 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  36.56 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  37.81 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  37.07 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  37.07 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  36.45 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  36.91 
 
 		 320 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  36.68 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  37.74 
 
 		 318 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  35.19 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  34.28 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  34.26 
 
 		 324 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  37.25 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  35.2 
 
 		 324 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  33.95 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  33.95 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  35.84 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  35.59 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  34.94 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  33.75 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  34.49 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  34.95 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  36.03 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  30.82 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  34.26 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  32.49 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  31.51 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  32.81 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  31.99 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  33.02 
 
 		 317 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 321 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  32.99 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  31.68 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  33.86 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  33.86 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  33.86 
 
 		 327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  33.68 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  32.41 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  32.34 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  30.23 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  29.33 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  31.17 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  30.85 
 
 		 304 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  30.19 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  32.55 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.72 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.65 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  32.69 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.62 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.62 
 
 		 292 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  28.34 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.92 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  29.91 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  27.02 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  28.21 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  28.62 
 
 		 287 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  28.04 
 
 		 292 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  28.85 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.62 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  30.94 
 
 		 292 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  27.65 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.25 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  25.35 
 
 		 289 aa  87  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  26.61 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3338  HpcH/HpaI aldolase  27.12 
 
 		 347 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1590  HpcH/HpaI aldolase  28.9 
 
 		 347 aa  85.9  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  27.47 
 
 		 295 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  25.69 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  27.1 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.87 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  28.62 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  30.03 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  25.47 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  27.36 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  26.5 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  28.86 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  27.65 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  27.84 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  24.85 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  25 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  27.81 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  26.69 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>