209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3338 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3338  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 347 aa  703    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1590  HpcH/HpaI aldolase  86.99 
 
 		 347 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  72.3 
 
 		 349 aa  508  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4695  HpcH/HpaI aldolase  39.86 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.152293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3363  HpcH/HpaI aldolase  39.49 
 
 		 441 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  30.31 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  27.42 
 
 		 320 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  30.07 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  28.11 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  27.84 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  28.52 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  26.3 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  26.75 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  24.34 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  26 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  27.3 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  26.49 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  26.64 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  25.77 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  25.75 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  26.82 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  26.82 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  26.32 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  27.02 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  29.24 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  23.24 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  28.71 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  29.09 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  26.22 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  24.74 
 
 		 379 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  25.14 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  25.17 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  25.14 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  25.17 
 
 		 318 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  25.87 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  29.93 
 
 		 282 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  26.74 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  28.44 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  27.34 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  26.74 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  26.19 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  26.74 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  29.03 
 
 		 292 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  34 
 
 		 301 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  29.19 
 
 		 355 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  26.2 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  27.12 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  25.69 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  26.13 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  25.69 
 
 		 303 aa  85.9  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  24.5 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  28.93 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  27.39 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  28.33 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  25.16 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  26.86 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  26.69 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  27.07 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  27.07 
 
 		 316 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  25.15 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  27.52 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  26.9 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  25.8 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  31.73 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  27.46 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  27 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  26.06 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  26.71 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  27.3 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  26.33 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  25.8 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  27.08 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  25.41 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  25.48 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  27.72 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  25.4 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  27.96 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  26.53 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.81 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  29.23 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  28.23 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  26.18 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.57 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  28.57 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  24.44 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  30.22 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  28.78 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  24.29 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  24.29 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  26.67 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  26.15 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  27.45 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  26.74 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  29.08 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  26.97 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  28.11 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  24.83 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  24.35 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  25.17 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  24.35 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>