77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4695 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3363  HpcH/HpaI aldolase  72.18 
 
 		 441 aa  668    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4695  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 436 aa  878    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.152293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  41.58 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3338  HpcH/HpaI aldolase  39.86 
 
 		 347 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1590  HpcH/HpaI aldolase  41.73 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  27.78 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  25.27 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  27 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  28.03 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  27.57 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  27.57 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  27.92 
 
 		 316 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  27.57 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  27.92 
 
 		 321 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  24.82 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  27.82 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  28.1 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  28.21 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  25.95 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  27.47 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  30.27 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  23.35 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  28.33 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  24.51 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  24.51 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  28.74 
 
 		 313 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  27.05 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  28.44 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  24.22 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  27.17 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  25.55 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  28.15 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  26.89 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  25.21 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  22.57 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  27.24 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  23.08 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  25 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  24.24 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  22.69 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  24.52 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  23.76 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  22.75 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  24.24 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  24 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  24.24 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  23.48 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  24.24 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  26.19 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  26.47 
 
 		 318 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  23.44 
 
 		 320 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  23.75 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  26.38 
 
 		 296 aa  53.5  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  25 
 
 		 292 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  29.31 
 
 		 298 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  25.85 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  26.67 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  28.29 
 
 		 308 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  25.47 
 
 		 292 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.03 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.03 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  29.84 
 
 		 304 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  31.18 
 
 		 292 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  24.58 
 
 		 292 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  23.89 
 
 		 297 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  25.18 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  28.4 
 
 		 286 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  27.4 
 
 		 282 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  32.56 
 
 		 296 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  32.56 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  32.56 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  21.46 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  30.99 
 
 		 297 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  24.34 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  23.17 
 
 		 291 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  23.75 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  26.82 
 
 		 298 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>