210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1590 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1590  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 347 aa  706    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3338  HpcH/HpaI aldolase  86.99 
 
 		 347 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  72.09 
 
 		 349 aa  501  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4695  HpcH/HpaI aldolase  41.73 
 
 		 436 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.152293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3363  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 441 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  30.03 
 
 		 303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  27.74 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  27.9 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  26.38 
 
 		 301 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  28.12 
 
 		 316 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  27.73 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  27.25 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  28.35 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  28.86 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  28.43 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  28.9 
 
 		 349 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  29.11 
 
 		 313 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  30.74 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  26.35 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  25.83 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  26.35 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  25.94 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  26.05 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  26.97 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  25.73 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  28.53 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  26.32 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  26.62 
 
 		 325 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  27.68 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  29.34 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  28.04 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  26.37 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  26.55 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  25.17 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  26.55 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  30.92 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  24.92 
 
 		 318 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  29.19 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  25.97 
 
 		 349 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  25.17 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  25.52 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  25.95 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  25.35 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  25.76 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  24.15 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  28.33 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  25.44 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  27.81 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  27.31 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  28.84 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  33 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  29.1 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  26.96 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  26.96 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  27.18 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  27.61 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  27.74 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  25.91 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  27.18 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  28.53 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  26.8 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.47 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  26.85 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  25.17 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  26.86 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  27.46 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  26.32 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  31.82 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.02 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  27.66 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  25.61 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  25.61 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  26.77 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  25.61 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  25.43 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  27.8 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  26.25 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  28.38 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  27.1 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  26.41 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  27.46 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  28.41 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  27.53 
 
 		 285 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  28.26 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  27.45 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  27.89 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  25.94 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  26.4 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  27.51 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  26.35 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  27.08 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  28.25 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  28.62 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  25.37 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  28.87 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  31.88 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  24.91 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  26.16 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>