70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3363 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3363  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 441 aa  902    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4695  HpcH/HpaI aldolase  72.18 
 
 		 436 aa  668    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.152293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3338  HpcH/HpaI aldolase  39.49 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  37.36 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1590  HpcH/HpaI aldolase  40.22 
 
 		 347 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  28.02 
 
 		 303 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  27.38 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  28.95 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  32.18 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  27.8 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  27.44 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  26.69 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  28.74 
 
 		 303 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  26.69 
 
 		 327 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  31.18 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  25.2 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  30.38 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  27.88 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  27.8 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  27.52 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  28.57 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  26.69 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  25.58 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  31.58 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  25.5 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  27.03 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  24.23 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  26.35 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  27.05 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  24.23 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  30.36 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  29.32 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  26.4 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  27.84 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  25.64 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  24.51 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  24.3 
 
 		 318 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  24.44 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  25.1 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  27.07 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  25.21 
 
 		 292 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  25.77 
 
 		 325 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  26.09 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  25.68 
 
 		 324 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  25.32 
 
 		 292 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  28.74 
 
 		 331 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  25.68 
 
 		 327 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  25.6 
 
 		 320 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  25.29 
 
 		 323 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  25.29 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  25.88 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  24.79 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  22.31 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  25.88 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  25 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  25.49 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  22.22 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  32.26 
 
 		 292 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  25.48 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  33.68 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  24.71 
 
 		 295 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  24.9 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  28.39 
 
 		 301 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  24.41 
 
 		 291 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  27.92 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  27.92 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.63 
 
 		 280 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.63 
 
 		 280 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  32.63 
 
 		 280 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  24.25 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>