More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3369 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  100 
 
 		 280 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  99.64 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  71.94 
 
 		 280 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  72.3 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  71.94 
 
 		 280 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  52.96 
 
 		 274 aa  294  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1653  putative citrate lyase, beta subunit  44.84 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1725  putative citrate lyase, beta subunit  44.84 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1932  putative citrate lyase, beta subunit  44.84 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0608  putative citrate lyase, beta subunit  44.84 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.46771  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0703  citrate lyase, beta subunit, putative  44.84 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2222  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  44.84 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2305  hypothetical protein  44.04 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.500849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  38.04 
 
 		 305 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  38.04 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  39.33 
 
 		 281 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1708  citrate lyase beta chain  37.45 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2921  HpcH/HpaI aldolase  38.58 
 
 		 280 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1045  HpcH/HpaI aldolase  41 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00200106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2717  citrate lyase  36.94 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.11 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  35.31 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35.83 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  36.04 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  35.18 
 
 		 318 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  35.18 
 
 		 318 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  35.43 
 
 		 341 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  36.1 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  35.41 
 
 		 325 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 		 323 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  35.53 
 
 		 324 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  37.5 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  36.73 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  35.2 
 
 		 324 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  34.53 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  35.34 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  35.53 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  34.2 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  34.54 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  34.54 
 
 		 325 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  37.89 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  35.34 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  33.01 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  39.5 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  34.11 
 
 		 320 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18610  citrate lyase beta subunit  35.66 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  37.76 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  39.71 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.43 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  36.68 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.62 
 
 		 291 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  33.45 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  35.59 
 
 		 406 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.25 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  39.08 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  35.46 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.27 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2184  HpcH/HpaI aldolase  36.57 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00433365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  35.29 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1535  Citryl-CoA lyase  37.1 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  36.75 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  36.17 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.4 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  39.43 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.71 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.65 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  32.51 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0459  HpcH/HpaI aldolase  30.86 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.255492 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.5 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.3 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3027  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  33.81 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.57 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.29 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  36.4 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  32.44 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  33.69 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  32.71 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.29 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5821  HpcH/HpaI aldolase  32.63 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.577572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  38.83 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4079  HpcH/HpaI aldolase  33.92 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  32.36 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  33.95 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  32.48 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.69 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  34.08 
 
 		 270 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0293  HpcH/HpaI aldolase  37.2 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0333809  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  32.03 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  33.45 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0989  putative citrate lyase, beta subunit  34.42 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.911423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>