More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6559 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 323 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  96.26 
 
 		 324 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  92.88 
 
 		 323 aa  625  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  91.95 
 
 		 324 aa  617  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  91.64 
 
 		 324 aa  614  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  91.64 
 
 		 324 aa  614  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  82.87 
 
 		 325 aa  551  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  82.24 
 
 		 327 aa  548  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  80.06 
 
 		 325 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  66.14 
 
 		 325 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  67.42 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  59.38 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  58.44 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  58.44 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  61.94 
 
 		 310 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  58.75 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  57.81 
 
 		 379 aa  362  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  55.56 
 
 		 318 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  57.05 
 
 		 318 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  60.74 
 
 		 316 aa  348  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  42.72 
 
 		 303 aa  257  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  47.76 
 
 		 313 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  44.23 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  45.51 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  43.22 
 
 		 317 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  43.95 
 
 		 338 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  44.87 
 
 		 312 aa  232  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  43.59 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  43.31 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  42.95 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  42.9 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  44.44 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  42.15 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  43.18 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  42.9 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  41.25 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  42.36 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  39.03 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  42.17 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  41.5 
 
 		 282 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  40.28 
 
 		 346 aa  208  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  39.87 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  40.45 
 
 		 319 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  37.42 
 
 		 363 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  39.81 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  38.95 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  38.95 
 
 		 349 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  38.95 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  38.41 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  38.92 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  38.41 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  38.34 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  36.13 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  37.11 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  38.61 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  36.71 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  36.62 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  36.36 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.82 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  36.45 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.45 
 
 		 292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  36.22 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  35.9 
 
 		 293 aa  165  9e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.7 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.91 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  33.23 
 
 		 296 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  35.18 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.91 
 
 		 269 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  34.7 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  36.64 
 
 		 301 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  35.5 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.62 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.12 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.56 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.29 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.6 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  32.8 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.79 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  33.86 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.75 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.49 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  31.05 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  32.59 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.53 
 
 		 280 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.53 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.53 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  34.58 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.53 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  35.2 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  34.87 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  32.48 
 
 		 306 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  32.35 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  32.48 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  33.88 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.75 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  36.16 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>