More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4173 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  92.77 
 
 		 350 aa  666    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  97.69 
 
 		 347 aa  697    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 		 347 aa  708    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  72.33 
 
 		 346 aa  527  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  72.62 
 
 		 371 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  69.91 
 
 		 350 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  69.63 
 
 		 349 aa  519  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  69.34 
 
 		 349 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  69.63 
 
 		 349 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  70.2 
 
 		 349 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  69.74 
 
 		 349 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  66.19 
 
 		 349 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  63.98 
 
 		 351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  59.54 
 
 		 363 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  56.73 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  40.62 
 
 		 325 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  40.21 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  37.12 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  36.91 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  36.91 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  37.15 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  36.91 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  38.28 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  36.73 
 
 		 324 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  34.59 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  36.68 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  38.08 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  36.71 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  36.97 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  36.39 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  36.39 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  36.97 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  35.97 
 
 		 327 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  31.53 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  37.6 
 
 		 282 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35.76 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  36.52 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  34.77 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  35.11 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  34.4 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  33.8 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  30.96 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  32.59 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  32.14 
 
 		 312 aa  133  6e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  30.41 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  31.65 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  31.89 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  31.21 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  31.89 
 
 		 336 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  34.02 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  31.94 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  31.89 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  32.04 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  32.03 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  33.68 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  29.9 
 
 		 331 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  31.69 
 
 		 318 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  31.63 
 
 		 319 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  30.9 
 
 		 338 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.03 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  30.97 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  30.34 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  30.34 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  31.71 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  27.44 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  26.48 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  28.71 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  29.32 
 
 		 292 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  29.62 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  27.27 
 
 		 282 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  27.76 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  29.55 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  29.23 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  29.91 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  31.54 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  28.71 
 
 		 269 aa  96.7  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  27.88 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  27.62 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  26.32 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.66 
 
 		 285 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  27.97 
 
 		 304 aa  94.4  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  27.72 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.34 
 
 		 285 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  28.18 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  26.71 
 
 		 274 aa  92.4  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  28.3 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  28.43 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  26.69 
 
 		 298 aa  90.9  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  29.47 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  26.82 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  27.72 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  28.92 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  28.92 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  27.37 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  28.88 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  27.3 
 
 		 291 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  30.03 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  29.49 
 
 		 296 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  28.93 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>