More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2147 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  99.66 
 
 		 296 aa  593  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  96.62 
 
 		 296 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  82.47 
 
 		 297 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  74.32 
 
 		 294 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  76.87 
 
 		 294 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  55.94 
 
 		 286 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  54.03 
 
 		 298 aa  291  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  58.06 
 
 		 300 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  50 
 
 		 292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  51.92 
 
 		 313 aa  281  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  48.6 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  51.08 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  50.69 
 
 		 292 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  49.3 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  49.66 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  50.34 
 
 		 293 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  50.36 
 
 		 292 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  53.52 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  48.42 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  48.74 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  47.74 
 
 		 284 aa  249  6e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  50 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  45.49 
 
 		 287 aa  241  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  48.26 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  48.45 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  47.89 
 
 		 285 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  47.54 
 
 		 285 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  47.14 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  47.12 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  45.13 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  45.14 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  51.2 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  51.92 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  47.06 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  48.63 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  50.86 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  48.72 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  40.61 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  41.1 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  42.03 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  39.86 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  39.19 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  40.59 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.1 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  35.09 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.99 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  35.09 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  34.15 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  33.44 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  34.39 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  33.44 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  33.82 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  34.74 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  34.4 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  29.6 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  32.89 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.63 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 		 317 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.66 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 		 324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.63 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  31.63 
 
 		 302 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  33.11 
 
 		 290 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  33.79 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  31.64 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  36.3 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  31.64 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  34.39 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  35.34 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.29 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  32.6 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.47 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  36.36 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  33.21 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.43 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  30.47 
 
 		 269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  35.94 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.94 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  35.94 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  35.94 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  35.94 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  38.29 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  35.94 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  31.27 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  33.44 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  31.96 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>