More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0199 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
289 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  77.7 
 
 
297 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  77.39 
 
 
297 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  59.21 
 
 
292 aa  325  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  64.79 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  77.35 
 
 
297 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  59.57 
 
 
286 aa  296  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  54.74 
 
 
298 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  54.45 
 
 
313 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  49.83 
 
 
292 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  50.54 
 
 
292 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  51.22 
 
 
287 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  48.08 
 
 
292 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  51.39 
 
 
292 aa  260  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  53.48 
 
 
295 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  52.63 
 
 
285 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  53.36 
 
 
284 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  52.28 
 
 
285 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  52.48 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  51.04 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  49.32 
 
 
296 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  51.24 
 
 
285 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  48.63 
 
 
296 aa  250  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  48.63 
 
 
296 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  51.23 
 
 
300 aa  249  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  50.68 
 
 
294 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  48.44 
 
 
297 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  51.97 
 
 
300 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  48.43 
 
 
292 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  49.82 
 
 
294 aa  234  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  52.6 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  50.55 
 
 
279 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  49.47 
 
 
331 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  46.95 
 
 
292 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  48.06 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  48.62 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  46.26 
 
 
308 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  43.25 
 
 
311 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  44.25 
 
 
302 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  51.07 
 
 
325 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  47.5 
 
 
277 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  48.89 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  43.45 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  41.4 
 
 
293 aa  190  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.28 
 
 
294 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  45.49 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  35.54 
 
 
296 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  41.05 
 
 
292 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  41.05 
 
 
292 aa  176  5e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  32.72 
 
 
284 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  40.43 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  36.49 
 
 
304 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  36.16 
 
 
318 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  36.16 
 
 
318 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.24 
 
 
302 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  37.24 
 
 
302 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.24 
 
 
302 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  37.24 
 
 
302 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  37.37 
 
 
306 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  35.11 
 
 
325 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35.83 
 
 
379 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.9 
 
 
302 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  40.52 
 
 
315 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  35.37 
 
 
290 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.9 
 
 
302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  36.81 
 
 
341 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  32.97 
 
 
269 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.36 
 
 
289 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  34.97 
 
 
318 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  36.73 
 
 
317 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  36.21 
 
 
291 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  34.22 
 
 
303 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.01 
 
 
289 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  39.92 
 
 
312 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.01 
 
 
289 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.01 
 
 
289 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  36.01 
 
 
289 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  36.55 
 
 
301 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.27 
 
 
324 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  35.52 
 
 
291 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.27 
 
 
324 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.27 
 
 
324 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  34.63 
 
 
318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  35.52 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  39.16 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  34.43 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  35.86 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  32.37 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  36.49 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  33.23 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  35.37 
 
 
291 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>