More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0213 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  45.33 
 
 
316 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  46.71 
 
 
316 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  45.27 
 
 
321 aa  255  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  42.16 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  44.52 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  43.14 
 
 
312 aa  249  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  44.33 
 
 
338 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  43.32 
 
 
315 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  47.49 
 
 
304 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  45 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  44.52 
 
 
318 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  41.75 
 
 
303 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  44.19 
 
 
312 aa  242  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  42 
 
 
321 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  42.07 
 
 
325 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  41.86 
 
 
313 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  42.14 
 
 
310 aa  237  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  44.26 
 
 
331 aa  235  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  41.2 
 
 
318 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  43.23 
 
 
316 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  41.91 
 
 
319 aa  228  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  40.72 
 
 
320 aa  227  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  42.9 
 
 
319 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  40.06 
 
 
325 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  40 
 
 
324 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  39.03 
 
 
327 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  38.71 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  39.87 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  39.03 
 
 
323 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  38.46 
 
 
324 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  39.53 
 
 
336 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  39.53 
 
 
327 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  40.2 
 
 
341 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  39.53 
 
 
327 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  39.2 
 
 
318 aa  215  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  37.82 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  37.82 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  38.02 
 
 
325 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  38.54 
 
 
301 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  38.87 
 
 
379 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  39.47 
 
 
318 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  38.87 
 
 
318 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  38.87 
 
 
318 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  39.93 
 
 
282 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  39.39 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  38.21 
 
 
318 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  34.49 
 
 
349 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  31.86 
 
 
371 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  34.18 
 
 
350 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  35.54 
 
 
349 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  33.55 
 
 
351 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  35.54 
 
 
349 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  34.63 
 
 
363 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  34.48 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  35.4 
 
 
292 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  35.4 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  33.87 
 
 
346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.49 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  34.65 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.56 
 
 
292 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.9 
 
 
306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  35.64 
 
 
292 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  33.75 
 
 
349 aa  160  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.33 
 
 
294 aa  159  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  32.38 
 
 
347 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 
347 aa  155  8e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
292 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.46 
 
 
293 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.78 
 
 
282 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.32 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  31.23 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 
350 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  33.67 
 
 
306 aa  149  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  36.07 
 
 
301 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  34.26 
 
 
292 aa  148  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  32.41 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  33 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.25 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  33.56 
 
 
313 aa  142  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.78 
 
 
302 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.78 
 
 
302 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.78 
 
 
302 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.78 
 
 
302 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  31.1 
 
 
290 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.78 
 
 
302 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.22 
 
 
308 aa  142  9e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  33.68 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  33 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  30.3 
 
 
289 aa  138  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  35.31 
 
 
291 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 
298 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  33.11 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.11 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  31.94 
 
 
349 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  33.78 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.78 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>