226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2984 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2984  HpcH/HpaI aldolase  100 
 
 
349 aa  705    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3338  HpcH/HpaI aldolase  72.3 
 
 
347 aa  508  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.189168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1590  HpcH/HpaI aldolase  73.56 
 
 
347 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4695  HpcH/HpaI aldolase  41.58 
 
 
436 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.152293  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3363  HpcH/HpaI aldolase  37.36 
 
 
441 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  31.94 
 
 
303 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  28.3 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  31.71 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  31.46 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  28.49 
 
 
325 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  29.19 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  28.12 
 
 
301 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  29.19 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  30.72 
 
 
313 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  29.66 
 
 
325 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  28.39 
 
 
317 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  29.79 
 
 
312 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  29.91 
 
 
313 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  27.11 
 
 
341 aa  101  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  27.25 
 
 
320 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  29.9 
 
 
312 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  28.71 
 
 
321 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  28.26 
 
 
379 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  28.66 
 
 
318 aa  99.4  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  26.02 
 
 
318 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  27.84 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  29.93 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  28.94 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  28.44 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  27.74 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  29.39 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  27.89 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  29.39 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  29.39 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  30.08 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  29.45 
 
 
338 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  30.28 
 
 
282 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  28.84 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  31.17 
 
 
304 aa  92.4  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  29.46 
 
 
349 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  28.47 
 
 
323 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  29.79 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  28.04 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  29.84 
 
 
321 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  29.84 
 
 
316 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0731  HpcH/HpaI aldolase  28.85 
 
 
349 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  27.05 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  27.65 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  27.65 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  28.98 
 
 
318 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  29.53 
 
 
355 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  28.91 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  28.91 
 
 
349 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  27.08 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  26.95 
 
 
325 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  24.63 
 
 
371 aa  86.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  29.27 
 
 
318 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  26.97 
 
 
318 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  27.56 
 
 
346 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  34 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  27.72 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  30.28 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  27.83 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  28.21 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  28.26 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  26.17 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  28.91 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  29.85 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  28.91 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  29.03 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  27.48 
 
 
294 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  26.95 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  26.83 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  31.31 
 
 
331 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  27.62 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  27.96 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  24.67 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0901  Citrate (pro-3S)-lyase  26.64 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  28.24 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  26.76 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  27.02 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  28.21 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  28 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  28.26 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  28.26 
 
 
292 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  27.78 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  27.92 
 
 
279 aa  69.7  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  28.43 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  27 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  29.37 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  26.89 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  28.09 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  31.78 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  25 
 
 
310 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  32.2 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  27.71 
 
 
286 aa  64.3  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  27.43 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  25.98 
 
 
289 aa  63.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  30.46 
 
 
347 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>