More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1777 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
312 aa  627  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  57.38 
 
 
321 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  60.87 
 
 
313 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  57.7 
 
 
318 aa  342  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  57.7 
 
 
317 aa  342  5e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  57.05 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  57.38 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  56.95 
 
 
321 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  58 
 
 
338 aa  331  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  56.19 
 
 
313 aa  329  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  58.67 
 
 
312 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  57.14 
 
 
319 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  56.86 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  55.52 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  53.82 
 
 
318 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  53.97 
 
 
327 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  53.97 
 
 
327 aa  298  6e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  53.97 
 
 
336 aa  298  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  53.31 
 
 
318 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  52.16 
 
 
319 aa  290  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  43.14 
 
 
303 aa  249  3e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  48.17 
 
 
304 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  42.21 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  42.24 
 
 
324 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  42.54 
 
 
325 aa  229  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  43.81 
 
 
331 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  41.25 
 
 
324 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  40.59 
 
 
323 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  41.58 
 
 
324 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  41.25 
 
 
323 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  41.58 
 
 
324 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  40.91 
 
 
320 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  40.26 
 
 
327 aa  215  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  40.26 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  40.33 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  39.17 
 
 
325 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  43.79 
 
 
316 aa  209  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  41.52 
 
 
310 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  38.44 
 
 
303 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  40.94 
 
 
341 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  41.22 
 
 
318 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  40.2 
 
 
320 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  43.68 
 
 
282 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  40 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  39.73 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  38.85 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  38.85 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  39.65 
 
 
301 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  37.37 
 
 
306 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  36.86 
 
 
292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.13 
 
 
292 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.93 
 
 
292 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.98 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  36.56 
 
 
286 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  33.79 
 
 
292 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  32.78 
 
 
296 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  34.49 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.29 
 
 
293 aa  146  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  34.49 
 
 
292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  34.53 
 
 
298 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.95 
 
 
294 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  32.9 
 
 
350 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  33.55 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  34.29 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  30.8 
 
 
271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  35.11 
 
 
292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  31.33 
 
 
371 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  32.39 
 
 
363 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 
294 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.68 
 
 
282 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  32.03 
 
 
355 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  32.62 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  29.01 
 
 
269 aa  136  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  32.5 
 
 
350 aa  136  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  33.56 
 
 
292 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  34.53 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.09 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  34.64 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4173  HpcH/HpaI aldolase  32.14 
 
 
347 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0912  HpcH/HpaI aldolase  32.14 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  30.29 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
306 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  30.29 
 
 
349 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  32.14 
 
 
349 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  33.79 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  33 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  32.57 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  33 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  32.08 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  31.85 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  29.97 
 
 
349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  28.78 
 
 
295 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  34.55 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  34 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  30.69 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  33.09 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  30.96 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.47 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  35.34 
 
 
298 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2235  citrate lyase, beta subunit  37.94 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>