More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2235 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2235  citrate lyase, beta subunit  100 
 
 
301 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1951  putative citrate lyase, beta subunit  94.46 
 
 
301 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.778867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2916  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  94.46 
 
 
301 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1273  citrate lyase beta subunit  94.46 
 
 
301 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1254  putative citrate lyase, beta subunit  94.46 
 
 
301 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3040  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  94.46 
 
 
301 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2229  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  94.46 
 
 
301 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0968  putative citrate lyase, beta subunit  94.46 
 
 
301 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1721  Citryl-CoA lyase  66.43 
 
 
304 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3163  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.13 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  37.89 
 
 
293 aa  159  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  40.62 
 
 
286 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.63 
 
 
292 aa  149  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  37.63 
 
 
292 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  41.3 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  39.31 
 
 
313 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.56 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  36.09 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
301 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  35.81 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  34.95 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  34.95 
 
 
318 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  37.15 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  35.28 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  37.33 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  36.21 
 
 
284 aa  136  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  37.16 
 
 
304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 
341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  33.9 
 
 
296 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  35.69 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  34.25 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  36.21 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  32.03 
 
 
282 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  33.97 
 
 
320 aa  132  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  32.28 
 
 
298 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  34.81 
 
 
296 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  35.06 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2641  Citryl-CoA lyase  31.49 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  35.45 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  35.45 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  35.45 
 
 
336 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  37.1 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.76 
 
 
284 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  37.94 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  34.81 
 
 
293 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.9 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  35.64 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  34.8 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  32.31 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7288  citrate lyase  29.53 
 
 
295 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.380781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  33.77 
 
 
318 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  30.39 
 
 
295 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7154  HpcH/HpaI aldolase  32.55 
 
 
291 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 
292 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  35.94 
 
 
315 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  36.4 
 
 
318 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  35.23 
 
 
318 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  34.14 
 
 
292 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  35.84 
 
 
275 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 
316 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  32.53 
 
 
297 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  35.59 
 
 
312 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  33.69 
 
 
321 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  36.27 
 
 
292 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  34.04 
 
 
294 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  34.62 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0381  Citryl-CoA lyase  30.99 
 
 
271 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  32.17 
 
 
406 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  37.14 
 
 
277 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3436  HpcH/HpaI aldolase  36.93 
 
 
278 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  34.41 
 
 
321 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  32.99 
 
 
298 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  34.75 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  29.93 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  36.3 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  31.31 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  29.71 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  30.35 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  34.43 
 
 
292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  37.98 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  30.35 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  29.84 
 
 
324 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.31 
 
 
325 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.91 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  36.01 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  35.19 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  33.56 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.39 
 
 
282 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  33.69 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  33.95 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  34.75 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  29.39 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  27.46 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  34.62 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.67 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  37.63 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  35.36 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>