More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6909 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
316 aa  631  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  50.33 
 
 
303 aa  293  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  43.81 
 
 
323 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  44.98 
 
 
327 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  44.3 
 
 
324 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  46.71 
 
 
303 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  44.27 
 
 
324 aa  255  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  44.27 
 
 
324 aa  255  6e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0830  citrate lyase  49.82 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0807208  normal  0.0919126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  43.59 
 
 
324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  44.23 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  43.51 
 
 
325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  44.3 
 
 
325 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  44.05 
 
 
320 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  46.2 
 
 
313 aa  249  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  46.58 
 
 
338 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  46.13 
 
 
310 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4030  citrate (pro-3S)-lyase  44.55 
 
 
316 aa  245  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  41.85 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  46.89 
 
 
318 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  44.52 
 
 
331 aa  242  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  44.88 
 
 
317 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1078  citrate lyase  47.39 
 
 
316 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  47.93 
 
 
313 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  45.51 
 
 
318 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  45.51 
 
 
315 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4534  Citryl-CoA lyase  43.77 
 
 
321 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.668521  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  42.21 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  41.18 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  48.32 
 
 
304 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  44.48 
 
 
301 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  44.37 
 
 
319 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  48.12 
 
 
319 aa  228  8e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  44.59 
 
 
318 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  43.14 
 
 
321 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  39.06 
 
 
318 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0341  citryl-CoA lyase  43.37 
 
 
318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.5619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  39.43 
 
 
379 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  38.91 
 
 
320 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  44.59 
 
 
312 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  39.8 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  39.8 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  43.61 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  43.61 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  37.83 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  43.61 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  42.86 
 
 
318 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.61 
 
 
294 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4300  Citrate (pro-3S)-lyase  42.76 
 
 
301 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.097194  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  38.62 
 
 
285 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  34.11 
 
 
296 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  38.18 
 
 
291 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  35.29 
 
 
269 aa  159  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7178  HpcH/HpaI aldolase  34.15 
 
 
350 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102062  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  38.28 
 
 
286 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  35.02 
 
 
304 aa  156  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.88 
 
 
292 aa  155  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3870  HpcH/HpaI aldolase  33.44 
 
 
346 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4213  HpcH/HpaI aldolase  34.42 
 
 
351 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  34.78 
 
 
293 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  36.55 
 
 
285 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1650  HpcH/HpaI aldolase  33.64 
 
 
349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  37.54 
 
 
292 aa  152  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4393  HpcH/HpaI aldolase  34.4 
 
 
363 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  36.55 
 
 
285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  36.27 
 
 
292 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  36.62 
 
 
313 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  37.28 
 
 
279 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  33.78 
 
 
292 aa  149  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.07 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4285  HpcH/HpaI aldolase  32.72 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0181473  normal  0.111861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3917  HpcH/HpaI aldolase  32.72 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.243397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3098  HpcH/HpaI aldolase  32.88 
 
 
371 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136599  normal  0.227792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.89 
 
 
302 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34 
 
 
302 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6315  HpcH/HpaI aldolase  33.67 
 
 
349 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185554  hitchhiker  0.008113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  35.17 
 
 
287 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  31.72 
 
 
282 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34 
 
 
302 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  35.08 
 
 
291 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4390  HpcH/HpaI aldolase  32.1 
 
 
349 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.345408  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.67 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  34.32 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2805  HpcH/HpaI aldolase  31.79 
 
 
355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  33.66 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  33.89 
 
 
295 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1328  HpcH/HpaI aldolase  31.27 
 
 
350 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  hitchhiker  0.00231317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  33.56 
 
 
292 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  34.46 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.67 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  33.78 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>