More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2975 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2975  Citryl-CoA lyase  100 
 
 		 325 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.3261 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5000  citrate (pro-3S)-lyase  59.21 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  53.05 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1974  Citryl-CoA lyase  55.04 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1428  Citryl-CoA lyase  48.94 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  47.5 
 
 		 286 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  48.93 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2107  Citryl-CoA lyase  49.1 
 
 		 296 aa  249  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5220  Citryl-CoA lyase  50.53 
 
 		 294 aa  249  4e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2147  citrate (pro-3S)-lyase  49.08 
 
 		 296 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.760774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2424  Citryl-CoA lyase  49.08 
 
 		 296 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0539  Citryl-CoA lyase  46.69 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5949  HpcH/HpaI aldolase  50.36 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  47.18 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  47.39 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0347  putative citrate lyase beta chain  47.83 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1200  citrate lyase  45.91 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  45.3 
 
 		 292 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0544  citrate (pro-3S)-lyase  48.72 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.368833 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2804  citrate lyase  47 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  47.81 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0341  Citryl-CoA lyase  46.69 
 
 		 292 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  46.57 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3299  citrate (pro-3S)-lyase  47.95 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  44.48 
 
 		 287 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3268  HpcH/HpaI aldolase  47.75 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0181  Citryl-CoA lyase  52.11 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0192  Citryl-CoA lyase  52.31 
 
 		 297 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0199  citrate (pro-3S)-lyase  50.71 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.31113  normal  0.0340148 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  43.68 
 
 		 285 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  43.12 
 
 		 295 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  43.68 
 
 		 285 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  43.32 
 
 		 285 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2287  citrate (pro-3S)-lyase  47.35 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  42.54 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4394  Citryl-CoA lyase  44.24 
 
 		 292 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0203  Citrate (pro-3S)-lyase  51.76 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3026  citrate (pro-3S)-lyase  44.52 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4219  Citrate (pro-3S)-lyase  41.9 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2882  Citryl-CoA lyase  41.58 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3895  Citrate (pro-3S)-lyase  41.55 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423668  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  39.07 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4356  citrate lyase beta subunit  40.81 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  38.21 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.39 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  31.16 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1192  Citrate (pro-3S)-lyase  34.15 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.151099  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8404  Citrate (pro-3S)-lyase  34.86 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.927075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.1 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  32.75 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.1 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.1 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 302 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  32.75 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  33.45 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0669  Citryl-CoA lyase  33.45 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  37.32 
 
 		 276 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  27.96 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  33.33 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4487  citrate (pro-3S)-lyase  33.8 
 
 		 318 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0353068  normal  0.0397424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4636  Citrate (pro-3S)-lyase  33.58 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  33.58 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  35.93 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  33.22 
 
 		 318 aa  132  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2209  Citryl-CoA lyase  32.98 
 
 		 318 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.759332  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  33.01 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0723  Citryl-CoA lyase  32.75 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0805  Citrate (pro-3S)-lyase  33.96 
 
 		 319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  34.17 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5195  Citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.152568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  32.42 
 
 		 379 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4000  citrate (pro-3S)-lyase  32.28 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.689771  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  31.63 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3986  Citryl-CoA lyase  32.28 
 
 		 336 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  31.63 
 
 		 324 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4060  citrate (pro-3S)-lyase  32.28 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.63 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.77 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  33.55 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  32.34 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  32.34 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  32.14 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2214  HpcH/HpaI aldolase  41.3 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0660288  normal  0.0595234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1777  Citrate (pro-3S)-lyase  31.43 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3004  citrate (pro-3S)-lyase  32.39 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  0.725704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0400  citrate lyase  30.6 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.726359  normal  0.0212977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  33.92 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1137  Citrate (pro-3S)-lyase  31.47 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.8 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  30.89 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7769  Citrate (pro-3S)-lyase  31.58 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>