More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1154 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1154  Citrate (pro-3S)-lyase  100 
 
 
288 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0803  HpcH/HpaI aldolase  62.93 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3115  Citrate (pro-3S)-lyase  56.74 
 
 
276 aa  275  6e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  70.05 
 
 
347 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  43.93 
 
 
287 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.66 
 
 
294 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  38.36 
 
 
296 aa  175  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  38.36 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  38.79 
 
 
292 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  38.43 
 
 
292 aa  166  5e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  38.54 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4082  citrate lyase  40.5 
 
 
270 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01440  conserved hypothetical protein  35.69 
 
 
330 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3086  Citryl-CoA lyase  35.07 
 
 
295 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000118565  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  36.86 
 
 
304 aa  155  7e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  37.88 
 
 
306 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  35.76 
 
 
306 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  38.46 
 
 
278 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  35.79 
 
 
308 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  34.75 
 
 
285 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  35.19 
 
 
306 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  34.75 
 
 
285 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  35.76 
 
 
306 aa  148  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  36.96 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  34.52 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3907  HpcH/HpaI aldolase  34.11 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0618  Citrate (pro-3S)-lyase  40.86 
 
 
270 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0840536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00470  citrate lyase beta subunit  42.7 
 
 
296 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  36.04 
 
 
271 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  35.84 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03577  citrate lyase beta subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13030)  34.98 
 
 
323 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1739  citrate lyase, beta subunit, putative  35.65 
 
 
320 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000771015  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  33.79 
 
 
282 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  38.85 
 
 
267 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  31.91 
 
 
284 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  35.34 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.76273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  33.92 
 
 
269 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.43 
 
 
286 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  37.59 
 
 
302 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0268  Citryl-CoA lyase  36.18 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283754  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  35 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2028  HpcH/HpaI aldolase  36.71 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2534  Citryl-CoA lyase  38.35 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.426943  normal  0.459191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  35.96 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4179  citrate lyase  38.57 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4171  Citryl-CoA lyase  38.57 
 
 
305 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00188553  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4374  HpcH/HpaI aldolase  37.04 
 
 
278 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  36.23 
 
 
275 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  35.25 
 
 
282 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  34.27 
 
 
269 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  32.8 
 
 
323 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  35.25 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  34.38 
 
 
406 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  32.69 
 
 
324 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  39.58 
 
 
282 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  37.14 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  34.01 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  36.06 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 
323 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  39.01 
 
 
271 aa  135  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  32.69 
 
 
324 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  32.69 
 
 
324 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3539  HpcH/HpaI aldolase  35.14 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  38.01 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.17 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.17 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.17 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  36.17 
 
 
280 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  37.04 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0580  HpcH/HpaI aldolase  36.97 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.64 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52850  acyl-CoA lyase beta chain  37.24 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0557827  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  36.68 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  33.7 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1313  putative citrate lyase beta subunit  39.58 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  35.47 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  35.03 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.64 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3189  citrate (pro-3S)-lyase  35.64 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0128752  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.77 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  32.69 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.64 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  37.21 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.64 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  31.9 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2874  putative citrate lyase subunit beta  32.73 
 
 
295 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.39 
 
 
289 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.39 
 
 
289 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.39 
 
 
289 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  34.39 
 
 
289 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.64 
 
 
302 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  32.99 
 
 
301 aa  132  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>